RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	GPR1	Q12361	961 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YPR117W	Q06116	2489 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	STE3	P06783	470 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YCL049C	P25577	312 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SPO73	P40031	143 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	FCY21	P40039	528 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SYG1	P40528	902 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	ALR2	P43553	858 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	IRC6	P43615	237 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.31	□□□□□ -0.6	not detected
YSC84	YHR016C	PEX10	Q05568	337 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YLR345W	Q06137	509 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	RSC3	Q06639	885 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	GRS2	Q06817	618 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	COS7	Q07788	383 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	BUD7	Q08754	746 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	GTT2	Q12390	233 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	MSF1	P08425	469 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	MET8	P15807	274 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	MNE1	P24720	663 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	ARA1	P38115	344 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	FMP23	P38231	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	ATG7	P38862	630 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	GDH3	P39708	457 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SOK1	P40317	901 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	HOC1	P47124	396 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	ROM1	P53046	1155 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YOR338W	Q99326	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	GIT1	P25346	518 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	LIP5	P32875	414 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YHR078W	P38799	552 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SSN3	P39073	555 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	EXO1	P39875	702 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	RPH1	P39956	796 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	GLG2	P47011	380 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	VHS1	Q03785	461 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	NSI1	Q12457	570 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	AI3	P03877	415 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	PBS2	P08018	668 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	ISF1	P32488	338 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SEA4	P38164	1038 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	VMA22	P38784	181 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	PEX28	P38848	579 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	DDI1	P40087	428 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	LAS21	P40367	830 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	CIA1	Q05583	330 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	TGL5	Q12043	749 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	RBD2	Q12270	262 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	SOL2	P37262	315 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	GPX2	P38143	162 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YBR071W	P38243	211 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	CEM1	P39525	442 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	MSE1	P48525	536 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	HST3	P53687	447 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YNL260C	P53846	198 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	NUP49	Q02199	472 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	VPS74	Q06385	345 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	RRT8	Q08219	342 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		11.27	□□□□□ -0.6
YSC84	YHR016C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	COQ8	P27697	501 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	YHR033W	P38690	423 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	PCL5	P38794	229 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	MOB1	P40484	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	BIT61	P47041	543 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	MNT2	P53059	558 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	CPR8	P53728	308 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	PRM1	P53835	661 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	YPL014W	Q02606	381 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	RNH1	Q04740	348 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	SCM3	Q12334	223 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	PEX34	P25584	144 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	EMC3	P36039	253 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	DBP8	P38719	431 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	YFL066C	P43538	392 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	NNF1	P47149	201 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	YGR015C	P53208	328 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YSC84	YHR016C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61

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