RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ASE1P50275 885 aa-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPT6Q01939 405 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HOT1Q03213 719 aa-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PPM1Q04081 328 aa-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YET2Q04210 160 aa-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CMS1Q07897 291 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPB2P08518 1224 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GLK1P17709 500 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SKT5P34226 696 aa-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POP2P39008 433 aa-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DSD1P53095 428 aa-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DRN1P53255 507 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VTI1Q04338 217 aa-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTT109Q07794 436 aa-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIX7Q07844 837 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data-0.66□□□□□ -2.52not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RAD52P06778 471 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SUI2P20459 304 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR100CP25606 316 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUB3P26449 341 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AXL2P38928 823 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL059CP40520 121 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFR054CP43622 192 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGL088WP53151 121 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MUM3Q08750 479 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LEU9Q12166 604 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARP7Q12406 477 aa-0.67□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KAR1P11927 433 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MIG1P27705 504 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZIP1P31111 875 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MUD1P32605 298 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR137WP38276 179 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FHL1P39521 936 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL208WP40159 199 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAD3P47074 515 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BIR1P47134 954 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTQ1P53944 314 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EIS1Q05050 843 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TEN1Q07921 160 aa-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZRC1P20107 442 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ELO2P25358 347 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRE11P32829 692 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FRM2P37261 193 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUR6P40096 142 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFR057WP43625 151 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CSL4P53859 292 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INP2Q03824 705 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TMA16Q08687 178 aa-0.69□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC16P09798 840 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YAR066WP0CX18 203 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR214WP0CX19 203 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNT1P25357 1226 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKR032WP36127 104 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCL7P40186 285 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LAM5P43560 674 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARE2P53629 642 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CNM67P53865 581 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INM2Q05533 292 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TFC7Q12415 435 aa-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG27Q12452 347 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC24P11433 854 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEL043WP32618 956 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNG2P38806 282 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IGD1P43598 195 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VHT1P53241 593 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR126WP53274 230 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INA17Q02888 182 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIF2Q06208 395 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR022CQ12139 1133 aa-0.71□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSI1P13712 422 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DEP1P31385 405 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CCT6P39079 546 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG18P43601 500 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTR3P43606 678 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BNS1P50084 137 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSC1Q03104 513 aa-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNX3Q08826 162 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FUS3P16892 353 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POL4P25615 582 aa-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TIP1P27654 210 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEF1P32622 495 aa-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KEL1P38853 1164 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ISC1P40015 477 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRS85P46944 698 aa-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RLM1Q12224 676 aa-0.73□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEP4P07267 405 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS23BP0CX30 145 aa-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CKA2P19454 339 aa-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADH7P25377 361 aa-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BOS1P25385 244 aa-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP133P36161 1157 aa-0.74□□□□□ -2.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NRG2P38082 220 aa-0.74□□□□□ -2.53
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