RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	IDP2	P41939	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YJL132W	P47014	750 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	ARK1	P53974	638 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	SOV1	Q04748	898 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	SAS3	P34218	831 aa		4.73	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	GCD10	P41814	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	VTC2	P43585	828 aa		4.73	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	PIR3	Q03180	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	CLB3	P24870	427 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YIM1	P28625	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	NDI1	P32340	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	REC114	P32841	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	YBP1	P38315	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	PCA1	P38360	1216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	AVT4	P50944	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	VTA1	Q06263	330 aa		4.72	□□□□□ -1.65
snR34	snR34	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	NIP100	P33420	868 aa		4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
snR34	snR34	YLL056C	Q12177	298 aa		4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	SCM3	Q12334	223 aa		4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.71	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	GYP6	P32806	458 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	POP6	P53218	158 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	CAF40	P53829	373 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	SIL1	Q08199	421 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	HNT3	Q08702	217 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	SFI1	Q12369	946 aa		4.7	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YCR100C	P25606	316 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	NPL6	P32832	435 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YCR041W	P37265	110 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	RRT5	P43607	289 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	BOR1	P53838	576 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	PNG1	Q02890	363 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	TLG2	Q08144	397 aa		4.69	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	HIP1	P06775	603 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	CBS2	P14905	389 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	NFU1	P32860	256 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	HCS1	P34243	683 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	AVT5	P38176	459 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	TRS85	P46944	698 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	PCP1	P53259	346 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	DSL1	P53847	754 aa		4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	PMR1	P13586	950 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	MRP4	P32902	394 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	VHC1	P38329	1120 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	ODC1	Q03028	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YMR155W	Q03795	547 aa		4.67	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.66	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	FMS1	P50264	508 aa		4.66	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	YIP1	P53039	248 aa		4.66	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	HSP31	Q04432	237 aa		4.66	□□□□□ -1.66
snR34	snR34	CHS1	P08004	1131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RIP1	P08067	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	CLC1	P17891	233 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RML2	P32611	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	ARA1	P38115	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YDR387C	Q04162	555 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YPL199C	Q08954	240 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.65	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	ECM25	P32525	599 aa		4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	BYE1	P36106	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	NAT2	P37293	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YFL067W	P43537	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	MRP51	Q02950	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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