RNA–Protein interactions for RNA: YNL198C

YNL198C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL198C, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL198C	YNL198C	YAR066W	P0CX18	203 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YHR214W	P0CX19	203 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	VMA16	P23968	213 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	RML2	P32611	393 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	SCC4	P40090	624 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	SLZ1	P40167	298 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PNG1	Q02890	363 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PCD1	Q12524	340 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	BNA4	P38169	460 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	GPI18	P38211	433 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	ATG12	P38316	186 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	OM14	P38325	134 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YER184C	P39961	794 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	URB2	P47108	1174 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	KTR6	P54070	446 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	LIP2	Q06005	328 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	MCH1	Q07376	486 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YDR061W	Q12298	539 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YBR137W	P38276	179 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PAF1	P38351	445 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YGL262W	P53054	175 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	THP1	Q08231	455 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	IMG1	P25626	169 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YPS1	P32329	569 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	LAM5	P43560	674 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	TRS85	P46944	698 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	HEL1	P36113	551 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	WSS1	P38838	269 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	PSD1	P39006	500 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	MDE1	P47095	244 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	RCO1	Q04779	684 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	AHC1	Q12433	566 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	YCL049C	P25577	312 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	YIR035C	P40579	254 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	YGR067C	P53243	804 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	ADA2	Q02336	434 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	RPB5	P20434	215 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	HIR2	P32480	875 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	MSS18	P08593	268 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	ECT1	P33412	323 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	CHL4	P38907	458 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	OXA1	P39952	402 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	PSF2	P40359	213 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	PLB3	Q08108	686 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	SNT1	P25357	1226 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	CDC50	P25656	391 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	ECM25	P32525	599 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	YJR030C	P47101	745 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	MTQ1	P53944	314 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	TFC6	Q06339	672 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	HIM1	Q06674	414 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	TIM18	Q08749	192 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	MTF2	P10849	440 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
YNL198C	YNL198C	SKN1	P33336	771 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	STB1	P42845	420 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	SLG1	P54867	378 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	TOF2	Q02208	771 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	YET2	Q04210	160 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL198C	YNL198C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	YBR144C	P34215	104 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	YKL133C	P36066	463 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	AAD10	P47182	288 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	NAM2	P11325	894 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	ATP11	P32453	318 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	SRB2	P34162	210 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	ALY1	P36117	915 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	YLR302C	O13544	120 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	STP2	P38704	541 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	YFR057W	P43625	151 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	BIR1	P47134	954 aa		0.38	□□□□□ -2.35
YNL198C	YNL198C	SOV1	Q04748	898 aa		0.38	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.7 ms