RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	KRE9	P39005	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC24	YMR117C	VTC2	P43585	828 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC24	YMR117C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPC24	YMR117C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPC24	YMR117C	CTF3	Q12748	733 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPC24	YMR117C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	ATP10	P18496	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	CPR3	P25719	182 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YHR218W	P38899	603 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	CLC1	P17891	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	NFU1	P32860	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	IDP2	P41939	412 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	PPH22	P23595	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	NDI1	P32340	513 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	SAS3	P34218	831 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	THI2	P38141	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	SPC19	Q03954	165 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	RRD2	Q12461	358 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YIM1	P28625	365 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	NIP100	P33420	868 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	HCS1	P34243	683 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	CAF40	P53829	373 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	PNG1	Q02890	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	PIR3	Q03180	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	GCD10	P41814	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	FMS1	P50264	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	WSC2	P53832	503 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	DSL1	P53847	754 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	ARK1	P53974	638 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	SCW10	Q04951	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YCR100C	P25606	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	ARA1	P38115	344 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	AVT4	P50944	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPC24	YMR117C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	REC107	P21651	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	VHC1	P38329	1120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	POP6	P53218	158 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	ODC1	Q03028	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	SIL1	Q08199	421 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	HNT3	Q08702	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	HIP1	P06775	603 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	PMR1	P13586	950 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	BYE1	P36106	594 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YCR041W	P37265	110 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	PCA1	P38360	1216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	RRT5	P43607	289 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	BOR1	P53838	576 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	HSP31	Q04432	237 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	RIP1	P08067	215 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	CBS2	P14905	389 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	RML2	P32611	393 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	MRP4	P32902	394 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	TRS85	P46944	698 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	PCP1	P53259	346 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	MRP51	Q02950	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	ECM25	P32525	599 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	SSU1	P41930	458 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	SSN8	P47821	323 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YIP1	P53039	248 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	TLG2	Q08144	397 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	MUM3	Q08750	479 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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