RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SHY1P53266 389 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YPL068CQ02749 293 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YMR210WQ03649 449 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SML1Q04964 104 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W PDR8Q06149 701 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RUP1Q12242 671 aa8.6□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W PET123P17558 318 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RPB10P22139 70 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W RIM1P32445 135 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W SEC61P32915 480 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W OAR1P35731 278 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W ASK1P35734 292 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W GIP3Q03016 1276 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YMR027WQ04371 470 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YLR177WQ06251 628 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W REX4Q08237 289 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W PUS9Q12069 462 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W COX17Q12287 69 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W YPL247CQ12523 523 aa8.59□□□□□ -1.03
YLR349WYLR349W LEU4P06208 619 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W HEM15P16622 393 aa8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W KAR4P25583 335 aa8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data8.58□□□□□ -1.04not detected
YLR349WYLR349W PAC1P39946 494 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YER034WP40022 185 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YNL320WP42840 284 aa8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W EAF7P53911 425 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YLR352WQ06479 807 aa8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W MCH5Q08777 521 aa8.58□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W NPR1P22211 790 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SPS22P25380 463 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W FUN30P31380 1131 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W GCG1P32656 232 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SOL3P38858 249 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YDR089WP38966 869 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W MIC19P43594 170 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SDT1P53078 280 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RPN14P53196 417 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YGR067CP53243 804 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W INN1P53901 409 aa8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W CMK1P27466 446 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W HES1P35843 434 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W APE4P38821 490 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W FRT2P39734 528 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W TOK1P40310 691 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SEC28P40509 296 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W PRM10P42946 383 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W PBP1P53297 722 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W IBD2P53892 351 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YSA1Q01976 231 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W GAS3Q03655 524 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W VTI1Q04338 217 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YET3Q07451 203 aa8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W AMD2P22580 549 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W MUD2P36084 527 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W BNA4P38169 460 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W ECO1P43605 281 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W MET12P46151 657 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YGL176CP46945 554 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SEH1P53011 349 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W LSM3P57743 89 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RMI1Q02685 241 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W REC102Q02721 264 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YMR209CQ03648 457 aa8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W COX6P00427 148 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W PBS2P08018 668 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W APN1P22936 367 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SSH4P32343 579 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W ETR1P38071 380 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W UBP6P43593 499 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SLT2Q00772 484 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W VPS16Q03308 798 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W MCM16Q12262 181 aa8.54□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data8.53□□□□□ -1.04not detected
YLR349WYLR349W SGV1P23293 657 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.53□□□□□ -1.04not detected
YLR349WYLR349W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W PTR2P32901 601 aa8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W VRP1P37370 817 aa8.53□□□□□ -1.04
YLR349WYLR349W SPC97P38863 823 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 123.4 ms