RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	CIA1	Q05583	330 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	VID22	Q05934	901 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PPM2	Q08282	695 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
SKG6	YHR149C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HIS5	P07172	385 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	COQ1	P18900	473 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	DMC1	P25453	334 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YIM1	P28625	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PEX2	P32800	271 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PDR3	P33200	976 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MAC1	P35192	417 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RIM2	P38127	377 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ERV15	P38312	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	COS8	P38723	381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ARN2	P38724	620 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HSE1	P38753	452 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PTC7	P38797	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NVJ1	P38881	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SHU2	P38957	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RFC2	P40348	353 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ACF4	P47129	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YJR107W	P47145	328 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PAC10	P48363	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ARK1	P53974	638 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PEX25	Q02969	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ADY4	Q05955	493 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ARO10	Q06408	635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GRS2	Q06817	618 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GRC3	Q07845	632 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TRM10	Q12400	293 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ISN1	Q99312	450 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ATP4	P05626	244 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SPS4	P09937	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GAL2	P13181	574 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YCL049C	P25577	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LDS1	P31379	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	DPH2	P32461	534 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
SKG6	YHR149C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	QDR1	P40475	563 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YIL054W	P40524	105 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YGL138C	P53122	345 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CLD1	P53264	445 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	VPS62	P53285	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RCF2	P53721	224 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	OCA2	P53949	197 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YAT1	P80235	687 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TIM44	Q01852	431 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CWC27	Q02770	301 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	KAR5	Q04746	504 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MRPL44	P19956	98 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MDL2	P33311	773 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	APT2	P36973	181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YBR241C	P38142	488 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MAL32	P38158	584 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	UBX7	P38349	436 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	IPT1	P38954	527 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	AVT2	P39981	480 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PEP8	P40335	379 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	IRC24	P40580	263 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RGD2	P43556	714 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	AGX1	P43567	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MOG1	P47123	218 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GTO1	P48239	356 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74

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