RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	ERG3	P32353	365 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	PPS1	P38148	807 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AIM18	P38884	321 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YHR202W	P38887	602 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	LTP1	P40347	161 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	AIM14	P53109	570 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	MAL13	P53338	473 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	REG1	Q00816	1014 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	OAZ1	Q02803	292 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	ARL3	Q02804	198 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	SKY1	Q03656	742 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	YDR444W	Q04093	687 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	THI73	Q07904	523 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	RFU1	Q08003	200 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	FRE3	Q08905	711 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	HAL9	Q12180	1030 aa		5.4	□□□□□ -1.54
VBA1	YMR088C	POM152	P39685	1337 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	COS2	P0CX12	379 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	COS3	P0CX13	379 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SLY1	P22213	666 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RRT12	P25381	491 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PHA2	P32452	334 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LIP5	P32875	414 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SPC29	P33419	253 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YOX1	P34161	385 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SKG1	P36169	355 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	AME1	P38313	324 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YHL008C	P38750	627 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ECM10	P39987	644 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	HIS6	P40545	261 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	IRC7	P43623	340 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	FMP33	P46998	180 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RTT101	P47050	842 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MRK1	P50873	501 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ORC5	P50874	479 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	UFD1	P53044	361 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CWC24	P53769	259 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.4	□□□□□ -1.55	not detected
VBA1	YMR088C	YPL071C	Q02864	156 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ATG23	Q06671	453 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YLR413W	Q06689	675 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YEH1	Q07804	573 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	FLC1	Q08967	793 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	NSL1	Q12143	216 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	GLO4	Q12320	285 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		5.4	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ESP1	Q03018	1630 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CDC9	P04819	755 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CBS1	P14066	229 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SNA3	P14359	133 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CKA1	P15790	372 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	STF2	P16965	84 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRE8	P23639	250 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	HCM1	P25364	564 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ACH1	P32316	526 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SPT14	P32363	452 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	UBP7	P40453	1071 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CHS6	P40955	746 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	AGP3	P43548	558 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CAF16	P43569	289 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PKP2	P53170	491 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TIM21	P53220	239 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ATP25	Q03153	612 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRM15	Q03262	622 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	TOS4	Q06266	489 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	OXR1	Q08952	273 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	CSM4	Q08955	156 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YDR262W	Q12331	272 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	YSP2	Q06681	1438 aa		5.39	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SWR1	Q05471	1514 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	MLP2	P40457	1679 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SEM1	O94742	89 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	COB	P00163	385 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PRC1	P00729	532 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	FLP1	P03870	423 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PHO81	P17442	1178 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	LAC1	P28496	418 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	AST1	P35183	429 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	DAD2	P36162	133 aa		5.38	□□□□□ -1.55
VBA1	YMR088C	PCA1	P38360	1216 aa		5.38	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.2 ms