RNA–Protein interactions for RNA: YML089C

YML089C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YML089C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML089CYML089C PDS5Q04264 1277 aa13.11□□□□□ -0.31
YML089CYML089C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
YML089CYML089C PSK1P31374 1356 aa13.09□□□□□ -0.31
YML089CYML089C PPH3P32345 308 aa13.09□□□□□ -0.31
YML089CYML089C LEU2P04173 364 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
YML089CYML089C RTG3P38165 486 aa13.02□□□□□ -0.33
YML089CYML089C FKH1P40466 484 aa13.02□□□□□ -0.33
YML089CYML089C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
YML089CYML089C CSE4P36012 229 aa12.97□□□□□ -0.33
YML089CYML089C PTP3P40048 928 aa12.97□□□□□ -0.33
YML089CYML089C RTF1P53064 558 aa12.96□□□□□ -0.33
YML089CYML089C SPT7P35177 1332 aa12.94□□□□□ -0.34
YML089CYML089C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
YML089CYML089C LEU3P08638 886 aa12.93□□□□□ -0.34
YML089CYML089C PDI1P17967 522 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
YML089CYML089C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
YML089CYML089C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
YML089CYML089C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
YML089CYML089C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
YML089CYML089C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
YML089CYML089C YML133CQ03099 1374 aa12.91□□□□□ -0.34
YML089CYML089C YLL067CQ07888 1374 aa12.91□□□□□ -0.34
YML089CYML089C YLL066CQ99208 1374 aa12.91□□□□□ -0.34
YML089CYML089C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
YML089CYML089C PRP43P53131 767 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
YML089CYML089C KAR2P16474 682 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
YML089CYML089C GRX4P32642 244 aa12.86□□□□□ -0.35
YML089CYML089C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
YML089CYML089C TAP42Q04372 366 aa12.85□□□□□ -0.35
YML089CYML089C ENT1Q12518 454 aa12.84□□□□□ -0.35
YML089CYML089C DPS1P04802 557 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
YML089CYML089C REB1P21538 810 aa12.82□□□□□ -0.36
YML089CYML089C ENP1P38333 483 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
YML089CYML089C GAS4Q08271 471 aa12.82□□□□□ -0.36
YML089CYML089C APP1P53933 587 aa12.81□□□□□ -0.36
YML089CYML089C NST1P53935 1240 aa12.81□□□□□ -0.36
YML089CYML089C PAP2P53632 584 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
YML089CYML089C TY4B-HP0C2J7 1802 aa12.77□□□□□ -0.37
YML089CYML089C TY4B-JP47024 1803 aa12.77□□□□□ -0.37
YML089CYML089C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
YML089CYML089C HIM1Q06674 414 aa12.77□□□□□ -0.37
YML089CYML089C TCB1Q12466 1186 aa12.77□□□□□ -0.37
YML089CYML089C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
YML089CYML089C ENV9Q08651 330 aa12.76□□□□□ -0.37
YML089CYML089C SLM3Q12093 417 aa12.76□□□□□ -0.37
YML089CYML089C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
YML089CYML089C TRK1P12685 1235 aa12.75□□□□□ -0.37
YML089CYML089C AUS1Q08409 1394 aa12.71□□□□□ -0.37
YML089CYML089C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
YML089CYML089C RPO41P13433 1351 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
YML089CYML089C XKS1P42826 600 aa12.68□□□□□ -0.38
YML089CYML089C IOC4Q04213 475 aa12.68□□□□□ -0.38
YML089CYML089C RSF2P46974 1380 aa12.67□□□□□ -0.38
YML089CYML089C IES2P40154 320 aa12.66□□□□□ -0.38
YML089CYML089C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
YML089CYML089C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
YML089CYML089C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data12.65□□□□□ -0.38not detected
YML089CYML089C YRF1-2P40105 1681 aa12.62□□□□□ -0.39
YML089CYML089C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
YML089CYML089C MEC3Q02574 474 aa12.6□□□□□ -0.39
YML089CYML089C YDL144CQ07589 356 aa12.6□□□□□ -0.39
YML089CYML089C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data12.59□□□□□ -0.39not detected
YML089CYML089C RPP0P05317 312 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
YML089CYML089C DSD1P53095 428 aa12.58□□□□□ -0.4
YML089CYML089C FKS3Q04952 1785 aa12.57□□□□□ -0.4
YML089CYML089C HSP104P31539 908 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
YML089CYML089C YKL133CP36066 463 aa12.57□□□□□ -0.4
YML089CYML089C RCR1P38212 213 aa12.57□□□□□ -0.4
YML089CYML089C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
YML089CYML089C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
YML089CYML089C CTF4Q01454 927 aa12.56□□□□□ -0.4
YML089CYML089C SNF2P22082 1703 aa12.56□□□□□ -0.4
YML089CYML089C MPP10P47083 593 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
YML089CYML089C SIR4P11978 1358 aa12.55□□□□□ -0.4
YML089CYML089C PRD1P25375 712 aa12.54□□□□□ -0.4
YML089CYML089C VPS27P40343 622 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
YML089CYML089C URB1P34241 1764 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
YML089CYML089C AOS1Q06624 347 aa12.53□□□□□ -0.4
YML089CYML089C CDC45Q08032 650 aa12.53□□□□□ -0.4
YML089CYML089C YIL177CP40434 1758 aa12.52□□□□□ -0.41
YML089CYML089C YJL225CP40889 1758 aa12.52□□□□□ -0.41
YML089CYML089C APC1P53886 1748 aa12.51□□□□□ -0.41
YML089CYML089C YRF1-4O13559 1382 aa12.51□□□□□ -0.41
YML089CYML089C ATG13Q06628 738 aa12.5□□□□□ -0.41
YML089CYML089C DOT5P40553 215 aa12.49□□□□□ -0.41
YML089CYML089C YJL181WP46987 611 aa12.49□□□□□ -0.41
YML089CYML089C YMR074CQ04773 145 aa12.49□□□□□ -0.41
YML089CYML089C LAM6Q08001 693 aa12.49□□□□□ -0.41
YML089CYML089C GLN1P32288 370 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
YML089CYML089C PRS1P32895 427 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
YML089CYML089C NTH2P35172 780 aa12.47□□□□□ -0.41
YML089CYML089C YNL050CP53952 270 aa12.47□□□□□ -0.41
YML089CYML089C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
YML089CYML089C ADE16P54113 591 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
YML089CYML089C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
YML089CYML089C THI22Q06490 572 aa12.46□□□□□ -0.41
YML089CYML089C COBP00163 385 aa12.45□□□□□ -0.42
YML089CYML089C UBP1P25037 809 aa12.45□□□□□ -0.42
YML089CYML089C TPD3P31383 635 aa12.45□□□□□ -0.42
YML089CYML089C PRP40P33203 583 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms