RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W MHP1P43638 1398 aa14.99□□□□□ -0.01
RNQ1YCL028W RCM1P53972 490 aa14.99□□□□□ -0.01
RNQ1YCL028W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RNQ1YCL028W AAD16Q02895 342 aa14.94□□□□□ -0.02
RNQ1YCL028W PPH3P32345 308 aa14.92□□□□□ -0.02
RNQ1YCL028W CPS1P27614 576 aa14.91□□□□□ -0.02
RNQ1YCL028W AVT3P36062 692 aa14.91□□□□□ -0.02
RNQ1YCL028W PDS5Q04264 1277 aa14.91□□□□□ -0.02
RNQ1YCL028W RPG1P38249 964 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
RNQ1YCL028W PSK1P31374 1356 aa14.87□□□□□ -0.03
RNQ1YCL028W RTG3P38165 486 aa14.83□□□□□ -0.04
RNQ1YCL028W FKH1P40466 484 aa14.83□□□□□ -0.04
RNQ1YCL028W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RNQ1YCL028W PRY3P47033 881 aa14.82□□□□□ -0.04
RNQ1YCL028W SPT7P35177 1332 aa14.78□□□□□ -0.04
RNQ1YCL028W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RNQ1YCL028W YML133CQ03099 1374 aa14.76□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W YLL067CQ07888 1374 aa14.76□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W YLL066CQ99208 1374 aa14.76□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W MTR4P47047 1073 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W PTP3P40048 928 aa14.73□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W LEU3P08638 886 aa14.72□□□□□ -0.05
RNQ1YCL028W ADE6P38972 1358 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W CSE4P36012 229 aa14.7□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W NST1P53935 1240 aa14.68□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W PRP43P53131 767 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RNQ1YCL028W PDI1P17967 522 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RNQ1YCL028W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RNQ1YCL028W RTF1P53064 558 aa14.63□□□□□ -0.07
RNQ1YCL028W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RNQ1YCL028W TAP42Q04372 366 aa14.59□□□□□ -0.07
RNQ1YCL028W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W ENP1P38333 483 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W GAS4Q08271 471 aa14.56□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W TRK1P12685 1235 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W KAR2P16474 682 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W REB1P21538 810 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W GRX4P32642 244 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W HIM1Q06674 414 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W ENT1Q12518 454 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W TY4B-HP0C2J7 1802 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W TY4B-JP47024 1803 aa14.55□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W DPS1P04802 557 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W APP1P53933 587 aa14.54□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W AUS1Q08409 1394 aa14.52□□□□□ -0.08
RNQ1YCL028W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RNQ1YCL028W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RNQ1YCL028W SLM3Q12093 417 aa14.48□□□□□ -0.09
RNQ1YCL028W PAP2P53632 584 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RNQ1YCL028W ENV9Q08651 330 aa14.47□□□□□ -0.09
RNQ1YCL028W TCB1Q12466 1186 aa14.46□□□□□ -0.09
RNQ1YCL028W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data14.44□□□□□ -0.1 RIP-Chip
RNQ1YCL028W YRF1-2P40105 1681 aa14.4□□□□□ -0.1
RNQ1YCL028W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
RNQ1YCL028W IOC4Q04213 475 aa14.39□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data14.38□□□□□ -0.11not detected
RNQ1YCL028W XKS1P42826 600 aa14.38□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W RSF2P46974 1380 aa14.35□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W IES2P40154 320 aa14.35□□□□□ -0.11
RNQ1YCL028W YIL177CP40434 1758 aa14.32□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W YJL225CP40889 1758 aa14.32□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W YDL144CQ07589 356 aa14.32□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W RCR1P38212 213 aa14.3□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W MPP10P47083 593 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W DSD1P53095 428 aa14.29□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W SNF2P22082 1703 aa14.28□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
RNQ1YCL028W URB1P34241 1764 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W FKS3Q04952 1785 aa14.27□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W RPP0P05317 312 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W PRD1P25375 712 aa14.26□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W PRS1P32895 427 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W HSP104P31539 908 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W APC1P53886 1748 aa14.24□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W SIR4P11978 1358 aa14.24□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W YKL133CP36066 463 aa14.24□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W VPS27P40343 622 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W MEC3Q02574 474 aa14.22□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W YRF1-4O13559 1382 aa14.22□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W THI22Q06490 572 aa14.21□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W CDC45Q08032 650 aa14.21□□□□□ -0.13
RNQ1YCL028W CTF4Q01454 927 aa14.2□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W NTH2P35172 780 aa14.19□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W DOT5P40553 215 aa14.18□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W AOS1Q06624 347 aa14.18□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W TPD3P31383 635 aa14.17□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W SAP155P43612 1002 aa14.17□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W ADE16P54113 591 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
RNQ1YCL028W SUI2P20459 304 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
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