RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeastyeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRX1YBL064C GEF1P37020 779 aa6.65□□□□□ -1.34
PRX1YBL064C RGR1P19263 1082 aa6.64□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C GYP1Q08484 637 aa6.64□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C CLB5P30283 435 aa6.63□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C YML020WQ03722 664 aa6.63□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C YBL036CP38197 257 aa6.61□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C SSA4P22202 642 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.6□□□□□ -1.35not detected
PRX1YBL064C GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C HST2P53686 357 aa6.59□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C NIS1P53939 407 aa6.59□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PRX1YBL064C BIO2P32451 375 aa6.58□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C SLX8P40072 274 aa6.58□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C FPK1P53739 893 aa6.58□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C ERG12P07277 443 aa6.57□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C RAM1P22007 431 aa6.57□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C YMR196WQ04336 1088 aa6.57□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C DPL1Q05567 589 aa6.57□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C CSC1Q06538 782 aa6.57□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C SDH2P21801 266 aa6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C SLI15P38283 698 aa6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C YPR109WQ06104 294 aa6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C YPR204WQ08995 1032 aa6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C RAD59Q12223 238 aa6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C MMP1Q12372 583 aa6.55□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C CPS1P27614 576 aa6.54□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C CSE4P36012 229 aa6.54□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C ESS1P22696 170 aa6.53□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C SCJ1P25303 377 aa6.53□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C TTI1P36097 1038 aa6.53□□□□□ -1.36
PRX1YBL064C RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C TFB4Q12004 338 aa6.52□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C YEL077CQ3E7X8 1277 aa6.52□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C YNL108CP53929 270 aa6.51□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C CDC73Q06697 393 aa6.51□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C SIT4P20604 311 aa6.5□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C YJU3P28321 313 aa6.5□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C BRE2P43132 505 aa6.5□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C PEX21P50091 288 aa6.49□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C SAS4Q04003 481 aa6.49□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C ARG8P18544 423 aa6.48□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C NOB1Q08444 459 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C ISU2Q12056 156 aa6.47□□□□□ -1.37
PRX1YBL064C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C GCR2Q01722 534 aa6.46□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C LAM6Q08001 693 aa6.44□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C CDC3P32457 520 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C SIS2P36024 562 aa6.43□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C RSC30P38781 883 aa6.43□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C SLY41P22215 453 aa6.42□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C MRX10Q05648 414 aa6.42□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C PUP1P25043 261 aa6.41□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C SLD2P34252 453 aa6.41□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C RIM21P48565 533 aa6.41□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C RTF1P53064 558 aa6.41□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C YML083CQ04526 418 aa6.41□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C PDR1P12383 1068 aa6.4□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C YNL115CP53925 644 aa6.4□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C YRR1Q12172 810 aa6.4□□□□□ -1.38
PRX1YBL064C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C MRX12P47084 519 aa6.39□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C TGL4P36165 910 aa6.37□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.37□□□□□ -1.39not detected
PRX1YBL064C YPP1P46951 817 aa6.36□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C KEX2P13134 814 aa6.34□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C PEP12P32854 288 aa6.34□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C PUS6P53294 404 aa6.34□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C MCM16Q12262 181 aa6.34□□□□□ -1.39
PRX1YBL064C HAT1Q12341 374 aa6.33□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C NUD1P32336 851 aa6.32□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C ERF2Q06551 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C CLA4P48562 842 aa6.31□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C MET22P32179 357 aa6.3□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C NOP7P53261 605 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C TBF1Q02457 562 aa6.3□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C KTR7P40504 517 aa6.29□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C SNU71P53207 620 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C ECM23Q02710 187 aa6.29□□□□□ -1.4
PRX1YBL064C HEM3P28789 327 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.9 ms