RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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PTPRVP-204ENST00000639439 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.07■■□□□ 1.6
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PTPRVP-204ENST00000639439 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.03■■□□□ 1.6
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PTPRVP-204ENST00000639439 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.93■■□□□ 1.58
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PTPRVP-204ENST00000639439 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.89■■□□□ 1.58
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PTPRVP-204ENST00000639439 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRVP-204ENST00000639439 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRVP-204ENST00000639439 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.77■■□□□ 1.56
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PTPRVP-204ENST00000639439 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTPRVP-204ENST00000639439 AGLP35573 1532 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRVP-204ENST00000639439 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.73■■□□□ 1.55
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PTPRVP-204ENST00000639439 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRVP-204ENST00000639439 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.52■■□□□ 1.52
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PTPRVP-204ENST00000639439 TSPY10P0CW01 314 aa24.46■■□□□ 1.51
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PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRVP-204ENST00000639439 ZMYM3Q14202 1370 aa24.45■■□□□ 1.5
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PTPRVP-204ENST00000639439 MIA2Q96PC5 1412 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRVP-204ENST00000639439 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.43■■□□□ 1.5
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PTPRVP-204ENST00000639439 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
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PTPRVP-204ENST00000639439 FBXO41Q8TF61 875 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRVP-204ENST00000639439 PTPRKQ15262 1439 aa24.33■■□□□ 1.49
PTPRVP-204ENST00000639439 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRVP-204ENST00000639439 STRCQ7RTU9 1775 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRVP-204ENST00000639439 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRVP-204ENST00000639439 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRVP-204ENST00000639439 PTPRTO14522 1441 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRVP-204ENST00000639439 NCOA1Q15788 1441 aa24.26■■□□□ 1.47
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