RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.44■■■■□ 3.74
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PTPRVP-204ENST00000639439 SMARCA2P51531 1590 aa29.84■■■□□ 2.37
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PTPRVP-204ENST00000639439 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
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PTPRVP-204ENST00000639439 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.72■■■□□ 2.19
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PTPRVP-204ENST00000639439 SHROOM2Q13796 1616 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRVP-204ENST00000639439 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRVP-204ENST00000639439 JPH4Q96JJ6 628 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRVP-204ENST00000639439 CUL7Q14999 1698 aa26.82■■□□□ 1.88
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