RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639000.1

SPIN3-217, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,055 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-217ENST00000639000 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.7■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.69■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 BCANQ96GW7 911 aa22.69■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.67■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 GRIN2AQ12879 1464 aa22.67■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 FOXD1Q16676 465 aa22.66■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SPIN3-217ENST00000639000 NEFLP07196 543 aa22.63■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.63■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 NCOA1Q15788 1441 aa22.62■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.61■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.59■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SPIN3-217ENST00000639000 CCDC7Q96M83 1385 aa22.57■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.55■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 PZPP20742 1482 aa22.55■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.54■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 CEP170Q5SW79 1584 aa22.52■■□□□ 1.2
SPIN3-217ENST00000639000 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.51■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 SYNJ2O15056 1496 aa22.5■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 ADGRL2O95490 1459 aa22.5■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.5■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.49■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 CCDC184Q52MB2 194 aa22.48■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.48■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 KIF14Q15058 1648 aa22.47■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 MBD5Q9P267 1494 aa22.46■■□□□ 1.19
SPIN3-217ENST00000639000 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.44■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.44■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 NUP160Q12769 1436 aa22.44■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.43■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 FBLN2P98095 1184 aa22.42■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
SPIN3-217ENST00000639000 JPH4Q96JJ6 628 aa22.38■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.38■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ABCA8O94911 1581 aa22.36■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.36■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.34■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 PKD2Q13563 968 aa22.34■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 MRS2Q9HD23 443 aa22.34■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.33■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.33■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.33■■□□□ 1.17
SPIN3-217ENST00000639000 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.32■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.31■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 ATP10BO94823 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.3■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.3■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 USP47Q96K76 1375 aa22.3■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.29■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.29■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.28■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.28■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 KDM5CP41229 1560 aa22.27■■□□□ 1.16
SPIN3-217ENST00000639000 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 CHD1O14646 1710 aa22.25■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.24■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 NUP155O75694 1391 aa22.23■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 PTPRGP23470 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.22■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.21■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.2■■□□□ 1.15
SPIN3-217ENST00000639000 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPIN3-217ENST00000639000 KIF15Q9NS87 1388 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIN3-217ENST00000639000 TSPY4P0CV99 314 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIN3-217ENST00000639000 TSPY10P0CW01 314 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIN3-217ENST00000639000 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPIN3-217ENST00000639000 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.09■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.08■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.08■■□□□ 1.13
SPIN3-217ENST00000639000 PREX2Q70Z35 1606 aa22.08■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.07■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 MSH5O43196 834 aa22.07■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.06■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.05■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.05■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.05■■□□□ 1.12
SPIN3-217ENST00000639000 NUDCQ9Y266 331 aa22.04■■□□□ 1.12
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