RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638121.1

CHML-204, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHML, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHML-204ENST00000638121 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.64■■■■■ 4.1
CHML-204ENST00000638121 PREX2Q70Z35 1606 aa40.64■■■■■ 4.1
CHML-204ENST00000638121 RICTORQ6R327 1708 aa40.64■■■■■ 4.1
CHML-204ENST00000638121 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.62■■■■■ 4.09
CHML-204ENST00000638121 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.59■■■■■ 4.09
CHML-204ENST00000638121 TIAM1Q13009 1591 aa40.58■■■■■ 4.09
CHML-204ENST00000638121 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.58■■■■■ 4.09
CHML-204ENST00000638121 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.08
CHML-204ENST00000638121 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.56■■■■■ 4.08
CHML-204ENST00000638121 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.55■■■■■ 4.08
CHML-204ENST00000638121 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.51■■■■■ 4.08
CHML-204ENST00000638121 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
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CHML-204ENST00000638121 MAP3K1Q13233 1512 aa40.46■■■■■ 4.07
CHML-204ENST00000638121 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.44■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.44■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 ABCC1P33527 1531 aa40.43■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 AFAP1Q8N556 730 aa40.43■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.43■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.42■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.41■■■■■ 4.06
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CHML-204ENST00000638121 NCOA2Q15596 1464 aa40.39■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 APLP2Q06481 763 aa40.39■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.39■■■■■ 4.06
CHML-204ENST00000638121 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
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CHML-204ENST00000638121 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.36■■■■■ 4.05
CHML-204ENST00000638121 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
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CHML-204ENST00000638121 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
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CHML-204ENST00000638121 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.28■■■■■ 4.04
CHML-204ENST00000638121 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.27■■■■■ 4.04
CHML-204ENST00000638121 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
CHML-204ENST00000638121 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.24■■■■■ 4.03
CHML-204ENST00000638121 ATP10AO60312 1499 aa40.24■■■■■ 4.03
CHML-204ENST00000638121 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.24■■■■■ 4.03
CHML-204ENST00000638121 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.17■■■■■ 4.02
CHML-204ENST00000638121 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.15■■■■■ 4.02
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CHML-204ENST00000638121 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.11■■■■■ 4.01
CHML-204ENST00000638121 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.1■■■■■ 4.01
CHML-204ENST00000638121 ABCA6Q8N139 1617 aa40.09■■■■■ 4.01
CHML-204ENST00000638121 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.09■■■■■ 4.01
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CHML-204ENST00000638121 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.91■■■■□ 3.98
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CHML-204ENST00000638121 TSPY10P0CW01 314 aa39.85■■■■□ 3.97
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CHML-204ENST00000638121 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.75■■■■□ 3.95
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CHML-204ENST00000638121 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.69■■■■□ 3.94
CHML-204ENST00000638121 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
CHML-204ENST00000638121 ABCC5O15440 1437 aa39.64■■■■□ 3.94
CHML-204ENST00000638121 GGT6Q6P531 493 aa39.62■■■■□ 3.93
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CHML-204ENST00000638121 DAPK1P53355 1430 aa39.59■■■■□ 3.93
CHML-204ENST00000638121 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CHML-204ENST00000638121 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
CHML-204ENST00000638121 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.57■■■■□ 3.93
CHML-204ENST00000638121 KIF3BO15066 747 aa39.57■■■■□ 3.93
CHML-204ENST00000638121 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.56■■■■□ 3.92
CHML-204ENST00000638121 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.55■■■■□ 3.92
CHML-204ENST00000638121 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.52■■■■□ 3.92
CHML-204ENST00000638121 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.47■■■■□ 3.91
CHML-204ENST00000638121 C3P01024 1663 aa39.47■■■■□ 3.91
CHML-204ENST00000638121 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.45■■■■□ 3.91
CHML-204ENST00000638121 MROH2AA6NES4 1674 aa39.44■■■■□ 3.9
CHML-204ENST00000638121 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
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CHML-204ENST00000638121 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.4■■■■□ 3.9
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