RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631641.1

DDX3X-222, Transcript of DEAD-box helicase 3 X-linked, human

TSL 3

Gene DDX3X, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX3X-222	ENST00000631641	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.46	□□□□□ -0.25
DDX3X-222	ENST00000631641	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.45	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.44	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.43	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.42	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
DDX3X-222	ENST00000631641	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.39	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	ATP10A	O60312	1499 aa		13.39	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	KDM5C	P41229	1560 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	MLEC	Q14165	292 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.34	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.33	□□□□□ -0.27
DDX3X-222	ENST00000631641	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	ABCC1	P33527	1531 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.33	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.31	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDX3X-222	ENST00000631641	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	AGL	P35573	1532 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	HSPA2	P54652	639 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.22	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.21	□□□□□ -0.29
DDX3X-222	ENST00000631641	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.21	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3	5e-7	■■■■□ 26.4
DDX3X-222	ENST00000631641	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.19	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.18	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.17	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	A2M	P01023	1474 aa		13.16	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.15	□□□□□ -0.3
DDX3X-222	ENST00000631641	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	C3	P01024	1663 aa		13.14	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	NPAT	Q14207	1427 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.13	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.12	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.11	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.1	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	GGT6	Q6P531	493 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.09	□□□□□ -0.31
DDX3X-222	ENST00000631641	PTPRT	O14522	1441 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.08	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.07	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.06	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.05	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.05	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.04	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.03	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.03	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.03	□□□□□ -0.32
DDX3X-222	ENST00000631641	KIF3B	O15066	747 aa		13.02	□□□□□ -0.33
DDX3X-222	ENST00000631641	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.02	□□□□□ -0.33
DDX3X-222	ENST00000631641	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.02	□□□□□ -0.33
DDX3X-222	ENST00000631641	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.02	□□□□□ -0.33
DDX3X-222	ENST00000631641	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.01	□□□□□ -0.33
DDX3X-222	ENST00000631641	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.01	□□□□□ -0.33
DDX3X-222	ENST00000631641	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33

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