RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622151.4

FOXP1-223, Transcript of forkhead box P1, human

TSL 3 BASIC

Gene FOXP1, Length 429 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXP1-223	ENST00000622151	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	PTPRM	P28827	1452 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.95	■■■□□ 2.07
FOXP1-223	ENST00000622151	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FOXP1-223	ENST00000622151	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FOXP1-223	ENST00000622151	MLEC	Q14165	292 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FOXP1-223	ENST00000622151	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.92	■■■□□ 2.06
FOXP1-223	ENST00000622151	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.9	■■■□□ 2.06
FOXP1-223	ENST00000622151	AFAP1	Q8N556	730 aa		27.89	■■■□□ 2.06
FOXP1-223	ENST00000622151	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		27.86	■■■□□ 2.05
FOXP1-223	ENST00000622151	ATP10A	O60312	1499 aa		27.84	■■■□□ 2.05
FOXP1-223	ENST00000622151	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.82	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.81	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.8	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.79	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.76	■■■□□ 2.04
FOXP1-223	ENST00000622151	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FOXP1-223	ENST00000622151	KDM5C	P41229	1560 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FOXP1-223	ENST00000622151	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.75	■■■□□ 2.03
FOXP1-223	ENST00000622151	ABCC1	P33527	1531 aa		27.74	■■■□□ 2.03
FOXP1-223	ENST00000622151	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.73	■■■□□ 2.03
FOXP1-223	ENST00000622151	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.71	■■■□□ 2.03
FOXP1-223	ENST00000622151	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.7	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.69	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.67	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02	2e-8	■■■■□ 22.9
FOXP1-223	ENST00000622151	HSPA2	P54652	639 aa		27.66	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.65	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		27.65	■■■□□ 2.02
FOXP1-223	ENST00000622151	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.63	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.62	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.58	■■■□□ 2.01
FOXP1-223	ENST00000622151	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.57	■■■□□ 2
FOXP1-223	ENST00000622151	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.57	■■■□□ 2
FOXP1-223	ENST00000622151	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.55	■■■□□ 2
FOXP1-223	ENST00000622151	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.54	■■■□□ 2
FOXP1-223	ENST00000622151	AGL	P35573	1532 aa		27.52	■■■□□ 2
FOXP1-223	ENST00000622151	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
FOXP1-223	ENST00000622151	FBXO41	Q8TF61	875 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FOXP1-223	ENST00000622151	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.51	■■□□□ 1.99
FOXP1-223	ENST00000622151	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.46	■■□□□ 1.99
FOXP1-223	ENST00000622151	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.45	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.43	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.41	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	A2M	P01023	1474 aa		27.41	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.4	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.4	■■□□□ 1.98
FOXP1-223	ENST00000622151	GGT6	Q6P531	493 aa		27.38	■■□□□ 1.97
FOXP1-223	ENST00000622151	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.38	■■□□□ 1.97
FOXP1-223	ENST00000622151	C3	P01024	1663 aa		27.36	■■□□□ 1.97
FOXP1-223	ENST00000622151	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.33	■■□□□ 1.97
FOXP1-223	ENST00000622151	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.32	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.31	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.31	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.3	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.3	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.29	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.29	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.27	■■□□□ 1.96
FOXP1-223	ENST00000622151	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.26	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.26	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	CERK	Q8TCT0	537 aa		27.26	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.26	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	APLP2	Q06481	763 aa		27.25	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	KIF3B	O15066	747 aa		27.23	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.23	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.23	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.22	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	NPAT	Q14207	1427 aa		27.22	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.21	■■□□□ 1.95
FOXP1-223	ENST00000622151	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.16	■■□□□ 1.94
FOXP1-223	ENST00000622151	STRC	Q7RTU9	1775 aa		27.16	■■□□□ 1.94
FOXP1-223	ENST00000622151	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.15	■■□□□ 1.94
FOXP1-223	ENST00000622151	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.14	■■□□□ 1.93
FOXP1-223	ENST00000622151	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.12	■■□□□ 1.93
FOXP1-223	ENST00000622151	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.11	■■□□□ 1.93
FOXP1-223	ENST00000622151	PTPRT	O14522	1441 aa		27.09	■■□□□ 1.93
FOXP1-223	ENST00000622151	NCOA1	Q15788	1441 aa		27.09	■■□□□ 1.93
FOXP1-223	ENST00000622151	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		27.08	■■□□□ 1.93
FOXP1-223	ENST00000622151	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		27.06	■■□□□ 1.92

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