RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622151.4

FOXP1-223, Transcript of forkhead box P1, human

TSL 3 BASIC

Gene FOXP1, Length 429 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXP1-223	ENST00000622151	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FOXP1-223	ENST00000622151	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.2	■■■■□ 3.71
FOXP1-223	ENST00000622151	ABCC9	O60706	1549 aa		38.15	■■■■□ 3.7
FOXP1-223	ENST00000622151	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.33	■■■■□ 3.41
FOXP1-223	ENST00000622151	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.25	■■■■□ 3.39
FOXP1-223	ENST00000622151	NACAD	O15069	1562 aa		36.11	■■■■□ 3.37
FOXP1-223	ENST00000622151	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.89	■■■■□ 3.34
FOXP1-223	ENST00000622151	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.64	■■■■□ 3.3
FOXP1-223	ENST00000622151	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.61	■■■■□ 3.29
FOXP1-223	ENST00000622151	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.48	■■■■□ 3.27
FOXP1-223	ENST00000622151	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.4	■■■■□ 3.26
FOXP1-223	ENST00000622151	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.28	■■■■□ 3.24
FOXP1-223	ENST00000622151	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.21	■■■■□ 3.23
FOXP1-223	ENST00000622151	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.95	■■■■□ 3.19
FOXP1-223	ENST00000622151	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.75	■■■■□ 3.15
FOXP1-223	ENST00000622151	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.39	■■■■□ 3.1
FOXP1-223	ENST00000622151	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.38	■■■■□ 3.09
FOXP1-223	ENST00000622151	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.32	■■■■□ 3.08
FOXP1-223	ENST00000622151	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FOXP1-223	ENST00000622151	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FOXP1-223	ENST00000622151	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.3	■■■□□ 2.92
FOXP1-223	ENST00000622151	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FOXP1-223	ENST00000622151	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
FOXP1-223	ENST00000622151	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FOXP1-223	ENST00000622151	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
FOXP1-223	ENST00000622151	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FOXP1-223	ENST00000622151	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.95	■■■□□ 2.87
FOXP1-223	ENST00000622151	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.92	■■■□□ 2.86
FOXP1-223	ENST00000622151	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FOXP1-223	ENST00000622151	NES	P48681	1621 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FOXP1-223	ENST00000622151	CUX2	O14529	1486 aa		32.71	■■■□□ 2.83
FOXP1-223	ENST00000622151	WIZ	O95785	1651 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FOXP1-223	ENST00000622151	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FOXP1-223	ENST00000622151	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FOXP1-223	ENST00000622151	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FOXP1-223	ENST00000622151	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FOXP1-223	ENST00000622151	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
FOXP1-223	ENST00000622151	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FOXP1-223	ENST00000622151	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
FOXP1-223	ENST00000622151	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FOXP1-223	ENST00000622151	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.05	■■■□□ 2.72
FOXP1-223	ENST00000622151	CFTR	P13569	1480 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FOXP1-223	ENST00000622151	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FOXP1-223	ENST00000622151	WDR62	O43379	1518 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FOXP1-223	ENST00000622151	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FOXP1-223	ENST00000622151	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
FOXP1-223	ENST00000622151	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.63	■■■□□ 2.65
FOXP1-223	ENST00000622151	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.51	■■■□□ 2.63
FOXP1-223	ENST00000622151	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.43	■■■□□ 2.62
FOXP1-223	ENST00000622151	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.4	■■■□□ 2.62
FOXP1-223	ENST00000622151	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.38	■■■□□ 2.61
FOXP1-223	ENST00000622151	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.36	■■■□□ 2.61
FOXP1-223	ENST00000622151	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
FOXP1-223	ENST00000622151	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.32	■■■□□ 2.6
FOXP1-223	ENST00000622151	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
FOXP1-223	ENST00000622151	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
FOXP1-223	ENST00000622151	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
FOXP1-223	ENST00000622151	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.1	■■■□□ 2.57
FOXP1-223	ENST00000622151	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
FOXP1-223	ENST00000622151	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.05	■■■□□ 2.56
FOXP1-223	ENST00000622151	SOGA1	O94964	1423 aa		31.04	■■■□□ 2.56
FOXP1-223	ENST00000622151	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.99	■■■□□ 2.55
FOXP1-223	ENST00000622151	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.97	■■■□□ 2.55
FOXP1-223	ENST00000622151	FBLN2	P98095	1184 aa		30.97	■■■□□ 2.55
FOXP1-223	ENST00000622151	CUX1	P39880	1505 aa		30.97	■■■□□ 2.55
FOXP1-223	ENST00000622151	CHD1	O14646	1710 aa		30.83	■■■□□ 2.53
FOXP1-223	ENST00000622151	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.83	■■■□□ 2.53
FOXP1-223	ENST00000622151	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.83	■■■□□ 2.53
FOXP1-223	ENST00000622151	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.83	■■■□□ 2.53
FOXP1-223	ENST00000622151	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.78	■■■□□ 2.52
FOXP1-223	ENST00000622151	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.77	■■■□□ 2.52
FOXP1-223	ENST00000622151	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.76	■■■□□ 2.52
FOXP1-223	ENST00000622151	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.74	■■■□□ 2.51
FOXP1-223	ENST00000622151	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.72	■■■□□ 2.51
FOXP1-223	ENST00000622151	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.7	■■■□□ 2.51
FOXP1-223	ENST00000622151	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.67	■■■□□ 2.5
FOXP1-223	ENST00000622151	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.65	■■■□□ 2.5
FOXP1-223	ENST00000622151	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.62	■■■□□ 2.49
FOXP1-223	ENST00000622151	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.59	■■■□□ 2.49
FOXP1-223	ENST00000622151	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.57	■■■□□ 2.48
FOXP1-223	ENST00000622151	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.54	■■■□□ 2.48
FOXP1-223	ENST00000622151	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.54	■■■□□ 2.48
FOXP1-223	ENST00000622151	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.51	■■■□□ 2.47
FOXP1-223	ENST00000622151	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.51	■■■□□ 2.47
FOXP1-223	ENST00000622151	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.49	■■■□□ 2.47
FOXP1-223	ENST00000622151	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.48	■■■□□ 2.47
FOXP1-223	ENST00000622151	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.47	■■■□□ 2.47
FOXP1-223	ENST00000622151	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.35	■■■□□ 2.45
FOXP1-223	ENST00000622151	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.31	■■■□□ 2.44
FOXP1-223	ENST00000622151	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.29	■■■□□ 2.44
FOXP1-223	ENST00000622151	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.27	■■■□□ 2.44
FOXP1-223	ENST00000622151	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.22	■■■□□ 2.43
FOXP1-223	ENST00000622151	NUP160	Q12769	1436 aa		30.17	■■■□□ 2.42
FOXP1-223	ENST00000622151	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.16	■■■□□ 2.42
FOXP1-223	ENST00000622151	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.07	■■■□□ 2.4
FOXP1-223	ENST00000622151	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30	■■■□□ 2.39
FOXP1-223	ENST00000622151	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.96	■■■□□ 2.39
FOXP1-223	ENST00000622151	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.95	■■■□□ 2.38
FOXP1-223	ENST00000622151	IGF1R	P08069	1367 aa		29.94	■■■□□ 2.38
FOXP1-223	ENST00000622151	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.94	■■■□□ 2.38

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