RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.88	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.87	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.86	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.86	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.85	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.83	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.83	■■■■■ 4.61
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRM	P28827	1452 aa		43.74	■■■■■ 4.59
LYNX1-208	ENST00000615007	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.73	■■■■■ 4.59
LYNX1-208	ENST00000615007	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.73	■■■■■ 4.59
LYNX1-208	ENST00000615007	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.73	■■■■■ 4.59
LYNX1-208	ENST00000615007	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.72	■■■■■ 4.59
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.7	■■■■■ 4.59
LYNX1-208	ENST00000615007	KDM5C	P41229	1560 aa		43.62	■■■■■ 4.57
LYNX1-208	ENST00000615007	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	43.6	■■■■■ 4.57
LYNX1-208	ENST00000615007	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.59	■■■■■ 4.57
LYNX1-208	ENST00000615007	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.59	■■■■■ 4.57
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP10A	O60312	1499 aa		43.57	■■■■■ 4.57
LYNX1-208	ENST00000615007	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.56	■■■■■ 4.56
LYNX1-208	ENST00000615007	ABCC1	P33527	1531 aa		43.54	■■■■■ 4.56
LYNX1-208	ENST00000615007	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.51	■■■■■ 4.56
LYNX1-208	ENST00000615007	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.5	■■■■■ 4.55
LYNX1-208	ENST00000615007	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.48	■■■■■ 4.55
LYNX1-208	ENST00000615007	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.47	■■■■■ 4.55
LYNX1-208	ENST00000615007	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.45	■■■■■ 4.55
LYNX1-208	ENST00000615007	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.43	■■■■■ 4.54
LYNX1-208	ENST00000615007	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.41	■■■■■ 4.54
LYNX1-208	ENST00000615007	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.41	■■■■■ 4.54
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.39	■■■■■ 4.54
LYNX1-208	ENST00000615007	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.39	■■■■■ 4.54
LYNX1-208	ENST00000615007	MLEC	Q14165	292 aa		43.39	■■■■■ 4.54
LYNX1-208	ENST00000615007	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.38	■■■■■ 4.53
LYNX1-208	ENST00000615007	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.53
LYNX1-208	ENST00000615007	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.35	■■■■■ 4.53
LYNX1-208	ENST00000615007	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.35	■■■■■ 4.53
LYNX1-208	ENST00000615007	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.33	■■■■■ 4.53
LYNX1-208	ENST00000615007	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.31	■■■■■ 4.52
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
LYNX1-208	ENST00000615007	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.28	■■■■■ 4.52
LYNX1-208	ENST00000615007	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.28	■■■■■ 4.52
LYNX1-208	ENST00000615007	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.27	■■■■■ 4.52
LYNX1-208	ENST00000615007	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.27	■■■■■ 4.52
LYNX1-208	ENST00000615007	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.25	■■■■■ 4.51
LYNX1-208	ENST00000615007	AGL	P35573	1532 aa		43.22	■■■■■ 4.51
LYNX1-208	ENST00000615007	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.22	■■■■■ 4.51
LYNX1-208	ENST00000615007	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.21	■■■■■ 4.51
LYNX1-208	ENST00000615007	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.19	■■■■■ 4.5
LYNX1-208	ENST00000615007	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.12	■■■■■ 4.49
LYNX1-208	ENST00000615007	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
LYNX1-208	ENST00000615007	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP7A	Q04656	1500 aa		43.09	■■■■■ 4.49
LYNX1-208	ENST00000615007	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.07	■■■■■ 4.49
LYNX1-208	ENST00000615007	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.07	■■■■■ 4.49
LYNX1-208	ENST00000615007	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.48
LYNX1-208	ENST00000615007	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.06	■■■■■ 4.48
LYNX1-208	ENST00000615007	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.03	■■■■■ 4.48
LYNX1-208	ENST00000615007	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LYNX1-208	ENST00000615007	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
LYNX1-208	ENST00000615007	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.96	■■■■■ 4.47
LYNX1-208	ENST00000615007	C3	P01024	1663 aa		42.95	■■■■■ 4.47
LYNX1-208	ENST00000615007	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
LYNX1-208	ENST00000615007	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.47
LYNX1-208	ENST00000615007	HSPA2	P54652	639 aa		42.94	■■■■■ 4.46
LYNX1-208	ENST00000615007	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.93	■■■■■ 4.46
LYNX1-208	ENST00000615007	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.92	■■■■■ 4.46
LYNX1-208	ENST00000615007	A2M	P01023	1474 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LYNX1-208	ENST00000615007	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.91	■■■■■ 4.46
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
LYNX1-208	ENST00000615007	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.88	■■■■■ 4.45
LYNX1-208	ENST00000615007	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LYNX1-208	ENST00000615007	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.84	■■■■■ 4.45
LYNX1-208	ENST00000615007	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.84	■■■■■ 4.45
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LYNX1-208	ENST00000615007	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.78	■■■■■ 4.44
LYNX1-208	ENST00000615007	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.71	■■■■■ 4.43
LYNX1-208	ENST00000615007	NPAT	Q14207	1427 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LYNX1-208	ENST00000615007	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.66	■■■■■ 4.42
LYNX1-208	ENST00000615007	GGT6	Q6P531	493 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LYNX1-208	ENST00000615007	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LYNX1-208	ENST00000615007	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
LYNX1-208	ENST00000615007	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.61	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.6	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.59	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.58	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.58	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	APLP2	Q06481	763 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LYNX1-208	ENST00000615007	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.56	■■■■■ 4.4
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.52	■■■■■ 4.4
LYNX1-208	ENST00000615007	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.51	■■■■■ 4.4
LYNX1-208	ENST00000615007	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LYNX1-208	ENST00000615007	KIF3B	O15066	747 aa		42.47	■■■■■ 4.39
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.46	■■■■■ 4.39
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
LYNX1-208	ENST00000615007	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		42.44	■■■■■ 4.38
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRT	O14522	1441 aa		42.41	■■■■■ 4.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126 ms