RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613308.4

RDM1-216, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene RDM1, Length 779 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-216ENST00000613308 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.66■□□□□ 0.9
RDM1-216ENST00000613308 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
RDM1-216ENST00000613308 DSG3P32926 999 aa20.65■□□□□ 0.9
RDM1-216ENST00000613308 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 AKNAQ7Z591 1439 aa20.61■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 MLECQ14165 292 aa20.61■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.6■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 FANCAO15360 1455 aa20.6■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.59■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.59■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.58■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RDM1-216ENST00000613308 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.57■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 SOCS7O14512 581 aa20.53■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.52■□□□□ 0.88
RDM1-216ENST00000613308 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.51■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.51■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 ILDR2Q71H61 639 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 SAMD9Q5K651 1589 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.5■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.49■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 RICTORQ6R327 1708 aa20.48■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.46■□□□□ 0.87
RDM1-216ENST00000613308 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.44■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.41■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.41■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.4■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 ATP10AO60312 1499 aa20.4■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 HECW1Q76N89 1606 aa20.4■□□□□ 0.86
RDM1-216ENST00000613308 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.39■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.38■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 PLCH2O75038 1416 aa20.37■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.37■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.35■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.34■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.34■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RDM1-216ENST00000613308 PTPRTO14522 1441 aa20.28■□□□□ 0.84
RDM1-216ENST00000613308 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.27■□□□□ 0.84
RDM1-216ENST00000613308 AFAP1Q8N556 730 aa20.27■□□□□ 0.84
RDM1-216ENST00000613308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
RDM1-216ENST00000613308 EEA1Q15075 1411 aa20.27■□□□□ 0.83
RDM1-216ENST00000613308 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.26■□□□□ 0.83
RDM1-216ENST00000613308 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RDM1-216ENST00000613308 STRCQ7RTU9 1775 aa20.24■□□□□ 0.83
RDM1-216ENST00000613308 ABCB7O75027 752 aa20.22■□□□□ 0.83
RDM1-216ENST00000613308 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.19■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.19■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 APLP2Q06481 763 aa20.19■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 FMN1Q68DA7 1419 aa20.18■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.18■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.17■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 SLC4A2P04920 1241 aa20.16■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 CLIP1P30622 1438 aa20.16■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RDM1-216ENST00000613308 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.14■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 KDM5CP41229 1560 aa20.13■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.13■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 NCOA1Q15788 1441 aa20.12■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.12■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 KIF14Q15058 1648 aa20.12■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.11■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.11■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.11■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 REREQ9P2R6 1566 aa20.1■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 C3P01024 1663 aa20.1■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 AGLP35573 1532 aa20.08■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 KCNA4P22459 653 aa20.08■□□□□ 0.81
RDM1-216ENST00000613308 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.07■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 PKD2Q13563 968 aa20.05■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 NPATQ14207 1427 aa20.04■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.04■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 ABCA6Q8N139 1617 aa20.04■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 ZMYM3Q14202 1370 aa20.04■□□□□ 0.8
RDM1-216ENST00000613308 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RDM1-216ENST00000613308 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.99■□□□□ 0.79
RDM1-216ENST00000613308 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RDM1-216ENST00000613308 ABCC1P33527 1531 aa19.97■□□□□ 0.79
RDM1-216ENST00000613308 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.95■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 TOM1O60784 492 aa19.94■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 PIP4K2BP78356 416 aa19.94■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 GGT6Q6P531 493 aa19.94■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 PLA2R1Q13018 1463 aa19.92■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 PREX2Q70Z35 1606 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 HSPA1LP34931 641 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 MROH2AA6NES4 1674 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.91■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.9■□□□□ 0.78
RDM1-216ENST00000613308 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms