RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607714.5

TIMM50-220, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM50, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-220ENST00000607714 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.59■■□□□ 1.85
TIMM50-220ENST00000607714 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.58■■□□□ 1.85
TIMM50-220ENST00000607714 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.58■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.56■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 KIF14Q15058 1648 aa26.55■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.53■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 CLIP1P30622 1438 aa26.52■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.52■■□□□ 1.84
TIMM50-220ENST00000607714 AFAP1Q8N556 730 aa26.51■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.5■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.48■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 ATP10AO60312 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 HSPA2P54652 639 aa26.46■■□□□ 1.83
TIMM50-220ENST00000607714 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.44■■□□□ 1.82
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.41■■□□□ 1.82
TIMM50-220ENST00000607714 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.41■■□□□ 1.82
TIMM50-220ENST00000607714 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.39■■□□□ 1.82
TIMM50-220ENST00000607714 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.39■■□□□ 1.81
TIMM50-220ENST00000607714 FBXO41Q8TF61 875 aa26.39■■□□□ 1.81
TIMM50-220ENST00000607714 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.38■■□□□ 1.81
TIMM50-220ENST00000607714 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TIMM50-220ENST00000607714 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.34■■□□□ 1.81
TIMM50-220ENST00000607714 KDM5CP41229 1560 aa26.33■■□□□ 1.81
TIMM50-220ENST00000607714 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TIMM50-220ENST00000607714 PREX2Q70Z35 1606 aa26.3■■□□□ 1.8
TIMM50-220ENST00000607714 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.29■■□□□ 1.8
TIMM50-220ENST00000607714 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.28■■□□□ 1.8
TIMM50-220ENST00000607714 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.27■■□□□ 1.8
TIMM50-220ENST00000607714 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.25■■□□□ 1.79
TIMM50-220ENST00000607714 ABCC1P33527 1531 aa26.25■■□□□ 1.79
TIMM50-220ENST00000607714 ABCA6Q8N139 1617 aa26.23■■□□□ 1.79
TIMM50-220ENST00000607714 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.22■■□□□ 1.79
TIMM50-220ENST00000607714 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
TIMM50-220ENST00000607714 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
TIMM50-220ENST00000607714 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 REREQ9P2R6 1566 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.18■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.17■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 AGLP35573 1532 aa26.15■■□□□ 1.78
TIMM50-220ENST00000607714 CERKQ8TCT0 537 aa26.14■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.11■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.11■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 C3P01024 1663 aa26.1■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.09■■□□□ 1.77
TIMM50-220ENST00000607714 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.06■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 STRCQ7RTU9 1775 aa26.04■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.04■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.03■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.02■■□□□ 1.76
TIMM50-220ENST00000607714 ATP7AQ04656 1500 aa26■■□□□ 1.75
TIMM50-220ENST00000607714 CEP162Q5TB80 1403 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM50-220ENST00000607714 ZMYM3Q14202 1370 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM50-220ENST00000607714 GGT6Q6P531 493 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM50-220ENST00000607714 A2MP01023 1474 aa25.97■■□□□ 1.75
TIMM50-220ENST00000607714 TIAM1Q13009 1591 aa25.94■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.93■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 PTPRTO14522 1441 aa25.91■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 MBD5Q9P267 1494 aa25.9■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 MROH2AA6NES4 1674 aa25.9■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 NPATQ14207 1427 aa25.9■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TIMM50-220ENST00000607714 PLXNC1O60486 1568 aa25.89■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.86■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.86■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 NCOA1Q15788 1441 aa25.86■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.84■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 NCOA2Q15596 1464 aa25.84■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.83■■□□□ 1.73
TIMM50-220ENST00000607714 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TIMM50-220ENST00000607714 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.82■■□□□ 1.72
TIMM50-220ENST00000607714 PTPRKQ15262 1439 aa25.81■■□□□ 1.72
TIMM50-220ENST00000607714 KIF3BO15066 747 aa25.81■■□□□ 1.72
TIMM50-220ENST00000607714 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMM50-220ENST00000607714 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.77■■□□□ 1.72
TIMM50-220ENST00000607714 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.76■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 TSPY4P0CV99 314 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 TSPY10P0CW01 314 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.74■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 PKD2Q13563 968 aa25.73■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.72■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.71■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.7■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms