RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607714.5

TIMM50-220, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM50, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-220ENST00000607714 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.53■■■■■ 4.08
TIMM50-220ENST00000607714 ABCC9O60706 1549 aa36.47■■■■□ 3.43
TIMM50-220ENST00000607714 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.29■■■■□ 3.4
TIMM50-220ENST00000607714 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.61■■■■□ 3.13
TIMM50-220ENST00000607714 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.47■■■■□ 3.11
TIMM50-220ENST00000607714 NACADO15069 1562 aa34.36■■■■□ 3.09
TIMM50-220ENST00000607714 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.31■■■■□ 3.08
TIMM50-220ENST00000607714 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.04
TIMM50-220ENST00000607714 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.83■■■■□ 3.01
TIMM50-220ENST00000607714 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.82■■■■□ 3
TIMM50-220ENST00000607714 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.61■■■□□ 2.97
TIMM50-220ENST00000607714 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
TIMM50-220ENST00000607714 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.4■■■□□ 2.94
TIMM50-220ENST00000607714 SCRIBQ14160 1630 aa33.15■■■□□ 2.9
TIMM50-220ENST00000607714 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
TIMM50-220ENST00000607714 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.88■■■□□ 2.85
TIMM50-220ENST00000607714 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.82■■■□□ 2.84
TIMM50-220ENST00000607714 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
TIMM50-220ENST00000607714 NCAPD3P42695 1498 aa31.76■■■□□ 2.67
TIMM50-220ENST00000607714 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.67■■■□□ 2.66
TIMM50-220ENST00000607714 SMARCA4P51532 1647 aa31.59■■■□□ 2.65
TIMM50-220ENST00000607714 SMARCA2P51531 1590 aa31.54■■■□□ 2.64
TIMM50-220ENST00000607714 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.49■■■□□ 2.63
TIMM50-220ENST00000607714 ERCC6Q03468 1493 aa31.47■■■□□ 2.63
TIMM50-220ENST00000607714 HMGXB3Q12766 1538 aa31.44■■■□□ 2.62
TIMM50-220ENST00000607714 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
TIMM50-220ENST00000607714 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TIMM50-220ENST00000607714 CUX2O14529 1486 aa31.33■■■□□ 2.61
TIMM50-220ENST00000607714 NESP48681 1621 aa31.32■■■□□ 2.6
TIMM50-220ENST00000607714 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.26■■■□□ 2.59
TIMM50-220ENST00000607714 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.24■■■□□ 2.59
TIMM50-220ENST00000607714 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31■■■□□ 2.55
TIMM50-220ENST00000607714 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.53
TIMM50-220ENST00000607714 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.88■■■□□ 2.53
TIMM50-220ENST00000607714 WIZO95785 1651 aa30.88■■■□□ 2.53
TIMM50-220ENST00000607714 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.85■■■□□ 2.53
TIMM50-220ENST00000607714 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.83■■■□□ 2.53
TIMM50-220ENST00000607714 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TIMM50-220ENST00000607714 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.58■■■□□ 2.49
TIMM50-220ENST00000607714 WDR62O43379 1518 aa30.48■■■□□ 2.47
TIMM50-220ENST00000607714 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.47■■■□□ 2.47
TIMM50-220ENST00000607714 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.46■■■□□ 2.47
TIMM50-220ENST00000607714 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TIMM50-220ENST00000607714 CFTRP13569 1480 aa30.43■■■□□ 2.46
TIMM50-220ENST00000607714 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
TIMM50-220ENST00000607714 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.17■■■□□ 2.42
TIMM50-220ENST00000607714 TRIM41Q8WV44 630 aa30.17■■■□□ 2.42
TIMM50-220ENST00000607714 OSCARQ8IYS5 282 aa30.06■■■□□ 2.4
TIMM50-220ENST00000607714 PRDM2Q13029 1718 aa30.05■■■□□ 2.4
TIMM50-220ENST00000607714 TOPBP1Q92547 1522 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
TIMM50-220ENST00000607714 IFT140Q96RY7 1462 aa29.86■■■□□ 2.37
TIMM50-220ENST00000607714 ABCC8Q09428 1581 aa29.8■■■□□ 2.36
TIMM50-220ENST00000607714 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.73■■■□□ 2.35
TIMM50-220ENST00000607714 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.333e-7■■■■□ 23.2
TIMM50-220ENST00000607714 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TIMM50-220ENST00000607714 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
TIMM50-220ENST00000607714 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
TIMM50-220ENST00000607714 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
TIMM50-220ENST00000607714 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
TIMM50-220ENST00000607714 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
TIMM50-220ENST00000607714 FBLN2P98095 1184 aa29.53■■■□□ 2.32
TIMM50-220ENST00000607714 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.51■■■□□ 2.31
TIMM50-220ENST00000607714 SOGA1O94964 1423 aa29.5■■■□□ 2.31
TIMM50-220ENST00000607714 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
TIMM50-220ENST00000607714 ARHGEF11O15085 1522 aa29.46■■■□□ 2.31
TIMM50-220ENST00000607714 CHD1O14646 1710 aa29.43■■■□□ 2.3
TIMM50-220ENST00000607714 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
TIMM50-220ENST00000607714 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.41■■■□□ 2.3
TIMM50-220ENST00000607714 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.39■■■□□ 2.29
TIMM50-220ENST00000607714 CUX1P39880 1505 aa29.35■■■□□ 2.29
TIMM50-220ENST00000607714 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
TIMM50-220ENST00000607714 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.25■■■□□ 2.27
TIMM50-220ENST00000607714 WDR97A6NE52 1622 aa29.2■■■□□ 2.26
TIMM50-220ENST00000607714 GRIN2BQ13224 1484 aa29.18■■■□□ 2.26
TIMM50-220ENST00000607714 ARAP1Q96P48 1450 aa29.17■■■□□ 2.26
TIMM50-220ENST00000607714 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TIMM50-220ENST00000607714 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
TIMM50-220ENST00000607714 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
TIMM50-220ENST00000607714 SYNJ2O15056 1496 aa29.07■■■□□ 2.24
TIMM50-220ENST00000607714 SYNJ1O43426 1573 aa29.06■■■□□ 2.24
TIMM50-220ENST00000607714 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.06■■■□□ 2.24
TIMM50-220ENST00000607714 PBRM1Q86U86 1689 aa29.02■■■□□ 2.24
TIMM50-220ENST00000607714 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.02■■■□□ 2.24
TIMM50-220ENST00000607714 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM50-220ENST00000607714 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
TIMM50-220ENST00000607714 TOP2BQ02880 1626 aa28.84■■■□□ 2.21
TIMM50-220ENST00000607714 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.83■■■□□ 2.21
TIMM50-220ENST00000607714 GRIN2AQ12879 1464 aa28.79■■■□□ 2.2
TIMM50-220ENST00000607714 ADAMTS12P58397 1594 aa28.73■■■□□ 2.19
TIMM50-220ENST00000607714 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.71■■■□□ 2.19
TIMM50-220ENST00000607714 CEP170Q5SW79 1584 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM50-220ENST00000607714 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM50-220ENST00000607714 NUP160Q12769 1436 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM50-220ENST00000607714 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.64■■■□□ 2.18
TIMM50-220ENST00000607714 SHROOM2Q13796 1616 aa28.53■■■□□ 2.16
TIMM50-220ENST00000607714 JPH4Q96JJ6 628 aa28.53■■■□□ 2.16
TIMM50-220ENST00000607714 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TIMM50-220ENST00000607714 IGF1RP08069 1367 aa28.37■■■□□ 2.13
TIMM50-220ENST00000607714 KIF27Q86VH2 1401 aa28.33■■■□□ 2.13
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