RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC5O15440 1437 aa30.96■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXD1Q16676 465 aa30.95■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNH8Q96L42 1107 aa30.95■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.95■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ROCK1Q13464 1354 aa30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF14Q15058 1648 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP10BO94823 1461 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCA8O94911 1581 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.7■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCOA1Q15788 1441 aa30.68■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPRGP23470 1445 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANP32CO43423 234 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.58■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PZPP20742 1482 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGRL2O95490 1459 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHD1O14646 1710 aa30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.51■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCER2I3L3R5 266 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PKD2Q13563 968 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPY4P0CV99 314 aa30.48■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPY10P0CW01 314 aa30.48■■■□□ 2.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUP155O75694 1391 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.39■■■□□ 2.46
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF15Q9NS87 1388 aa30.37■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MBD5Q9P267 1494 aa30.35■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SHROOM2Q13796 1616 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC7Q96M83 1385 aa30.29■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.26■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.26■■■□□ 2.44
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PREX2Q70Z35 1606 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC2Q92887 1545 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.21■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.21■■■□□ 2.43
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.19■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.16■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.14■■■□□ 2.42
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC184Q52MB2 194 aa30.14■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP47Q96K76 1375 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FKBP8Q14318 412 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCANQ96GW7 911 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.09■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.04■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.02■■■□□ 2.4
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLCH2O75038 1416 aa30■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRS2Q9HD23 443 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGL3Q3MIN7 710 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.98■■■□□ 2.39
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.96■■■□□ 2.39
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