RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603546.1

GNAS-256, Transcript of GNAS complex locus, human

TSL 5

Gene GNAS, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNAS-256	ENST00000603546	KIF14	Q15058	1648 aa		44.31	■■■■■ 4.68
GNAS-256	ENST00000603546	PTPRM	P28827	1452 aa		44.29	■■■■■ 4.68
GNAS-256	ENST00000603546	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		44.26	■■■■■ 4.68
GNAS-256	ENST00000603546	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		44.24	■■■■■ 4.67
GNAS-256	ENST00000603546	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		44.24	■■■■■ 4.67
GNAS-256	ENST00000603546	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		44.24	■■■■■ 4.67
GNAS-256	ENST00000603546	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	44.22	■■■■■ 4.67
GNAS-256	ENST00000603546	MADD	Q8WXG6	1647 aa		44.16	■■■■■ 4.66
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		44.15	■■■■■ 4.66
GNAS-256	ENST00000603546	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		44.13	■■■■■ 4.65
GNAS-256	ENST00000603546	ATP10A	O60312	1499 aa		44.06	■■■■■ 4.64
GNAS-256	ENST00000603546	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		44.06	■■■■■ 4.64
GNAS-256	ENST00000603546	AFAP1	Q8N556	730 aa		44.05	■■■■■ 4.64
GNAS-256	ENST00000603546	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		44.04	■■■■■ 4.64
GNAS-256	ENST00000603546	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		44.04	■■■■■ 4.64
GNAS-256	ENST00000603546	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	44	■■■■■ 4.63
GNAS-256	ENST00000603546	MLEC	Q14165	292 aa		43.98	■■■■■ 4.63
GNAS-256	ENST00000603546	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.98	■■■■■ 4.63
GNAS-256	ENST00000603546	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.97	■■■■■ 4.63
GNAS-256	ENST00000603546	KDM5C	P41229	1560 aa		43.96	■■■■■ 4.63
GNAS-256	ENST00000603546	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		43.92	■■■■■ 4.62
GNAS-256	ENST00000603546	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.86	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.86	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC1	P33527	1531 aa		43.85	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		43.85	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.84	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	43.84	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		43.83	■■■■■ 4.61
GNAS-256	ENST00000603546	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.82	■■■■■ 4.6
GNAS-256	ENST00000603546	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		43.8	■■■■■ 4.6
GNAS-256	ENST00000603546	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.78	■■■■■ 4.6
GNAS-256	ENST00000603546	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.77	■■■■■ 4.6
GNAS-256	ENST00000603546	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.77	■■■■■ 4.6
GNAS-256	ENST00000603546	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		43.76	■■■■■ 4.6
GNAS-256	ENST00000603546	RERE	Q9P2R6	1566 aa		43.73	■■■■■ 4.59
GNAS-256	ENST00000603546	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.73	■■■■■ 4.59
GNAS-256	ENST00000603546	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.73	■■■■■ 4.59
GNAS-256	ENST00000603546	ABCA6	Q8N139	1617 aa		43.7	■■■■■ 4.59
GNAS-256	ENST00000603546	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.68	■■■■■ 4.58
GNAS-256	ENST00000603546	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.67	■■■■■ 4.58
GNAS-256	ENST00000603546	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.67	■■■■■ 4.58
GNAS-256	ENST00000603546	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.64	■■■■■ 4.58	2e-13	■■□□□ 13.8
GNAS-256	ENST00000603546	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		43.63	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	AGL	P35573	1532 aa		43.63	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	HSPA2	P54652	639 aa		43.62	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.61	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	43.6	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.59	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.58	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	43.57	■■■■■ 4.57
GNAS-256	ENST00000603546	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.53	■■■■■ 4.56
GNAS-256	ENST00000603546	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
GNAS-256	ENST00000603546	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.48	■■■■■ 4.55
GNAS-256	ENST00000603546	TIAM1	Q13009	1591 aa		43.45	■■■■■ 4.55
GNAS-256	ENST00000603546	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	43.44	■■■■■ 4.54
GNAS-256	ENST00000603546	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		43.42	■■■■■ 4.54
GNAS-256	ENST00000603546	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.42	■■■■■ 4.54
GNAS-256	ENST00000603546	ATP7A	Q04656	1500 aa		43.4	■■■■■ 4.54
GNAS-256	ENST00000603546	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		43.37	■■■■■ 4.53
GNAS-256	ENST00000603546	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	43.34	■■■■■ 4.53
GNAS-256	ENST00000603546	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.34	■■■■■ 4.53
GNAS-256	ENST00000603546	C3	P01024	1663 aa		43.33	■■■■■ 4.53
GNAS-256	ENST00000603546	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		43.33	■■■■■ 4.53
GNAS-256	ENST00000603546	MBD5	Q9P267	1494 aa		43.32	■■■■■ 4.53
GNAS-256	ENST00000603546	A2M	P01023	1474 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GNAS-256	ENST00000603546	NCOA2	Q15596	1464 aa		43.29	■■■■■ 4.52
GNAS-256	ENST00000603546	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.29	■■■■■ 4.52
GNAS-256	ENST00000603546	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	43.28	■■■■■ 4.52
GNAS-256	ENST00000603546	PLXNC1	O60486	1568 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GNAS-256	ENST00000603546	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		43.22	■■■■■ 4.51
GNAS-256	ENST00000603546	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		43.21	■■■■■ 4.51
GNAS-256	ENST00000603546	ZMYM3	Q14202	1370 aa		43.2	■■■■■ 4.51
GNAS-256	ENST00000603546	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.18	■■■■■ 4.5
GNAS-256	ENST00000603546	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GNAS-256	ENST00000603546	GGT6	Q6P531	493 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GNAS-256	ENST00000603546	MROH2A	A6NES4	1674 aa		43.17	■■■■■ 4.5
GNAS-256	ENST00000603546	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		43.15	■■■■■ 4.5
GNAS-256	ENST00000603546	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		43.14	■■■■■ 4.5
GNAS-256	ENST00000603546	NPAT	Q14207	1427 aa		43.13	■■■■■ 4.49
GNAS-256	ENST00000603546	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		43.13	■■■■■ 4.49
GNAS-256	ENST00000603546	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.11	■■■■■ 4.49
GNAS-256	ENST00000603546	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	43.1	■■■■■ 4.49
GNAS-256	ENST00000603546	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		43.1	■■■■■ 4.49
GNAS-256	ENST00000603546	MAP3K1	Q13233	1512 aa		43.07	■■■■■ 4.49
GNAS-256	ENST00000603546	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	43.05	■■■■■ 4.48
GNAS-256	ENST00000603546	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.05	■■■■■ 4.48
GNAS-256	ENST00000603546	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
GNAS-256	ENST00000603546	TSPY4	P0CV99	314 aa		43.01	■■■■■ 4.48
GNAS-256	ENST00000603546	TSPY10	P0CW01	314 aa		43.01	■■■■■ 4.48
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GNAS-256	ENST00000603546	KIF3B	O15066	747 aa		42.96	■■■■■ 4.47
GNAS-256	ENST00000603546	PTPRT	O14522	1441 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GNAS-256	ENST00000603546	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.95	■■■■■ 4.47
GNAS-256	ENST00000603546	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.9	■■■■■ 4.46
GNAS-256	ENST00000603546	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GNAS-256	ENST00000603546	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.85	■■■■■ 4.45
GNAS-256	ENST00000603546	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GNAS-256	ENST00000603546	APLP2	Q06481	763 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GNAS-256	ENST00000603546	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GNAS-256	ENST00000603546	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.78	■■■■■ 4.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms