RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600964.1

AP2S1-208, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AP2S1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-208ENST00000600964 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
AP2S1-208ENST00000600964 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
AP2S1-208ENST00000600964 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.07■■■□□ 2.4
AP2S1-208ENST00000600964 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
AP2S1-208ENST00000600964 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.06■■■□□ 2.4
AP2S1-208ENST00000600964 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
AP2S1-208ENST00000600964 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.03■■■□□ 2.4
AP2S1-208ENST00000600964 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.01■■■□□ 2.39
AP2S1-208ENST00000600964 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.98■■■□□ 2.39
AP2S1-208ENST00000600964 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
AP2S1-208ENST00000600964 CLIP1P30622 1438 aa29.95■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 ATP10AO60312 1499 aa29.93■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.93■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 KDM5CP41229 1560 aa29.92■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.91■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.91■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.91■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.89■■■□□ 2.38
AP2S1-208ENST00000600964 PREX2Q70Z35 1606 aa29.89■■■□□ 2.37
AP2S1-208ENST00000600964 AFAP1Q8N556 730 aa29.87■■■□□ 2.37
AP2S1-208ENST00000600964 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.87■■■□□ 2.37
AP2S1-208ENST00000600964 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.86■■■□□ 2.37
AP2S1-208ENST00000600964 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.86■■■□□ 2.37
AP2S1-208ENST00000600964 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.84■■■□□ 2.37
AP2S1-208ENST00000600964 MLECQ14165 292 aa29.8■■■□□ 2.36
AP2S1-208ENST00000600964 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.8■■■□□ 2.36
AP2S1-208ENST00000600964 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.79■■■□□ 2.36
AP2S1-208ENST00000600964 ABCC1P33527 1531 aa29.79■■■□□ 2.36
AP2S1-208ENST00000600964 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.79■■■□□ 2.36
AP2S1-208ENST00000600964 REREQ9P2R6 1566 aa29.78■■■□□ 2.36
AP2S1-208ENST00000600964 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.76■■■□□ 2.35
AP2S1-208ENST00000600964 ABCA6Q8N139 1617 aa29.75■■■□□ 2.35
AP2S1-208ENST00000600964 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.73■■■□□ 2.35
AP2S1-208ENST00000600964 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
AP2S1-208ENST00000600964 HSPA2P54652 639 aa29.7■■■□□ 2.35
AP2S1-208ENST00000600964 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.69■■■□□ 2.34
AP2S1-208ENST00000600964 AGLP35573 1532 aa29.67■■■□□ 2.34
AP2S1-208ENST00000600964 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
AP2S1-208ENST00000600964 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.67■■■□□ 2.34
AP2S1-208ENST00000600964 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.66■■■□□ 2.34
AP2S1-208ENST00000600964 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
AP2S1-208ENST00000600964 FBXO41Q8TF61 875 aa29.63■■■□□ 2.33
AP2S1-208ENST00000600964 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.61■■■□□ 2.33
AP2S1-208ENST00000600964 C3P01024 1663 aa29.6■■■□□ 2.33
AP2S1-208ENST00000600964 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.57■■■□□ 2.32
AP2S1-208ENST00000600964 STRCQ7RTU9 1775 aa29.55■■■□□ 2.32
AP2S1-208ENST00000600964 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.54■■■□□ 2.32
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
AP2S1-208ENST00000600964 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
AP2S1-208ENST00000600964 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.5■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.49■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.48■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 TIAM1Q13009 1591 aa29.47■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 ATP7AQ04656 1500 aa29.46■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 CEP162Q5TB80 1403 aa29.45■■■□□ 2.31
AP2S1-208ENST00000600964 MROH2AA6NES4 1674 aa29.44■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.44■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 PLXNC1O60486 1568 aa29.43■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.43■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.43■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 MBD5Q9P267 1494 aa29.4■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
AP2S1-208ENST00000600964 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
AP2S1-208ENST00000600964 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.37■■■□□ 2.29
AP2S1-208ENST00000600964 A2MP01023 1474 aa29.36■■■□□ 2.29
AP2S1-208ENST00000600964 CERKQ8TCT0 537 aa29.36■■■□□ 2.29
AP2S1-208ENST00000600964 ZMYM3Q14202 1370 aa29.33■■■□□ 2.29
AP2S1-208ENST00000600964 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
AP2S1-208ENST00000600964 NPATQ14207 1427 aa29.32■■■□□ 2.28
AP2S1-208ENST00000600964 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.32■■■□□ 2.28
AP2S1-208ENST00000600964 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.29■■■□□ 2.28
AP2S1-208ENST00000600964 PTPRTO14522 1441 aa29.28■■■□□ 2.28
AP2S1-208ENST00000600964 NCOA2Q15596 1464 aa29.27■■■□□ 2.28
AP2S1-208ENST00000600964 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.23■■■□□ 2.27
AP2S1-208ENST00000600964 NCOA1Q15788 1441 aa29.22■■■□□ 2.27
AP2S1-208ENST00000600964 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.22■■■□□ 2.27
AP2S1-208ENST00000600964 PTPRKQ15262 1439 aa29.2■■■□□ 2.27
AP2S1-208ENST00000600964 GGT6Q6P531 493 aa29.2■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.19■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.17■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.17■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.17■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.16■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.16■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.14■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.14■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.14■■■□□ 2.26
AP2S1-208ENST00000600964 MAP3K1Q13233 1512 aa29.11■■■□□ 2.25
AP2S1-208ENST00000600964 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
AP2S1-208ENST00000600964 PLA2R1Q13018 1463 aa29.07■■■□□ 2.24
AP2S1-208ENST00000600964 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.05■■■□□ 2.24
AP2S1-208ENST00000600964 KIF3BO15066 747 aa29.05■■■□□ 2.24
AP2S1-208ENST00000600964 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
AP2S1-208ENST00000600964 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms