RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599722.1

MED25-208, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 3

Gene MED25, Length 504 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-208	ENST00000599722	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MED25-208	ENST00000599722	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MED25-208	ENST00000599722	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.31	■■■□□ 2.76
MED25-208	ENST00000599722	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MED25-208	ENST00000599722	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
MED25-208	ENST00000599722	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MED25-208	ENST00000599722	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MED25-208	ENST00000599722	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.26	■■■□□ 2.76
MED25-208	ENST00000599722	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.25	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.23	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.23	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MED25-208	ENST00000599722	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
MED25-208	ENST00000599722	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MED25-208	ENST00000599722	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.14	■■■□□ 2.74
MED25-208	ENST00000599722	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
MED25-208	ENST00000599722	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MED25-208	ENST00000599722	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
MED25-208	ENST00000599722	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.11	■■■□□ 2.73
MED25-208	ENST00000599722	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
MED25-208	ENST00000599722	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MED25-208	ENST00000599722	ABCC1	P33527	1531 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.05	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.04	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.03	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.02	■■■□□ 2.72
MED25-208	ENST00000599722	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.99	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	KDM5C	P41229	1560 aa		31.97	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.96	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MED25-208	ENST00000599722	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MED25-208	ENST00000599722	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.92	■■■□□ 2.7
MED25-208	ENST00000599722	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7
MED25-208	ENST00000599722	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.9	■■■□□ 2.7
MED25-208	ENST00000599722	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	ATP10A	O60312	1499 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MED25-208	ENST00000599722	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.77	■■■□□ 2.68
MED25-208	ENST00000599722	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	DAPK1	P53355	1430 aa		31.74	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	MLEC	Q14165	292 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	ABCC5	O15440	1437 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MED25-208	ENST00000599722	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MED25-208	ENST00000599722	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MED25-208	ENST00000599722	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MED25-208	ENST00000599722	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MED25-208	ENST00000599722	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.64	■■■□□ 2.66
MED25-208	ENST00000599722	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.6	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	ITGAE	P38570	1179 aa		31.6	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	AGL	P35573	1532 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	ROCK1	Q13464	1354 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	PTPRM	P28827	1452 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	A2M	P01023	1474 aa		31.58	■■■□□ 2.65
MED25-208	ENST00000599722	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.51	■■■□□ 2.64
MED25-208	ENST00000599722	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.51	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MED25-208	ENST00000599722	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
MED25-208	ENST00000599722	NAIP	Q13075	1403 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MED25-208	ENST00000599722	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.41	■■■□□ 2.62

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