RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594965.1

GTF2F1-204, Transcript of general transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF2F1, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1-204ENST00000594965 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.83■■■■□ 3.33
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GTF2F1-204ENST00000594965 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.77■■■■□ 3.32
GTF2F1-204ENST00000594965 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.69■■■■□ 3.3
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GTF2F1-204ENST00000594965 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
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GTF2F1-204ENST00000594965 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.66■■■■□ 3.3
GTF2F1-204ENST00000594965 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.65■■■■□ 3.3
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GTF2F1-204ENST00000594965 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.64■■■■□ 3.3
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GTF2F1-204ENST00000594965 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.59■■■■□ 3.29
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GTF2F1-204ENST00000594965 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.54■■■■□ 3.28
GTF2F1-204ENST00000594965 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.54■■■■□ 3.28
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GTF2F1-204ENST00000594965 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.47■■■■□ 3.27
GTF2F1-204ENST00000594965 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
GTF2F1-204ENST00000594965 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.46■■■■□ 3.27
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GTF2F1-204ENST00000594965 ABCA6Q8N139 1617 aa35.45■■■■□ 3.27
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GTF2F1-204ENST00000594965 MAP3K1Q13233 1512 aa35.43■■■■□ 3.26
GTF2F1-204ENST00000594965 NCOA2Q15596 1464 aa35.43■■■■□ 3.26
GTF2F1-204ENST00000594965 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.42■■■■□ 3.26
GTF2F1-204ENST00000594965 PTPRMP28827 1452 aa35.41■■■■□ 3.26
GTF2F1-204ENST00000594965 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.4■■■■□ 3.26
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GTF2F1-204ENST00000594965 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.35■■■■□ 3.25
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
GTF2F1-204ENST00000594965 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
GTF2F1-204ENST00000594965 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.33■■■■□ 3.25
GTF2F1-204ENST00000594965 MLECQ14165 292 aa35.3■■■■□ 3.24
GTF2F1-204ENST00000594965 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
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GTF2F1-204ENST00000594965 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.1■■■■□ 3.21
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GTF2F1-204ENST00000594965 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.1■■■■□ 3.21
GTF2F1-204ENST00000594965 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.08■■■■□ 3.21
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GTF2F1-204ENST00000594965 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.74■■■■□ 3.15
GTF2F1-204ENST00000594965 KIF3BO15066 747 aa34.74■■■■□ 3.15
GTF2F1-204ENST00000594965 DAPK1P53355 1430 aa34.72■■■■□ 3.15
GTF2F1-204ENST00000594965 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.7■■■■□ 3.15
GTF2F1-204ENST00000594965 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
GTF2F1-204ENST00000594965 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
GTF2F1-204ENST00000594965 NPATQ14207 1427 aa34.67■■■■□ 3.14
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