RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592372.5

SLC25A39-215, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 867 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-215ENST00000592372 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A39-215ENST00000592372 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC25A39-215ENST00000592372 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-215ENST00000592372 TIAM1Q13009 1591 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-215ENST00000592372 PREX2Q70Z35 1606 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-215ENST00000592372 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-215ENST00000592372 RICTORQ6R327 1708 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 AFAP1Q8N556 730 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC25A39-215ENST00000592372 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 MAP3K1Q13233 1512 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 NCOA2Q15596 1464 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 ABCC1P33527 1531 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC25A39-215ENST00000592372 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 KDM5CP41229 1560 aa26.47■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.45■■□□□ 1.83
SLC25A39-215ENST00000592372 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.45■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 APLP2Q06481 763 aa26.45■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.43■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 ATP10AO60312 1499 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC25A39-215ENST00000592372 MBD5Q9P267 1494 aa26.37■■□□□ 1.81
SLC25A39-215ENST00000592372 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-215ENST00000592372 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SLC25A39-215ENST00000592372 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-215ENST00000592372 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-215ENST00000592372 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC25A39-215ENST00000592372 ABCA6Q8N139 1617 aa26.32■■□□□ 1.8
SLC25A39-215ENST00000592372 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-215ENST00000592372 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC25A39-215ENST00000592372 MLECQ14165 292 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC25A39-215ENST00000592372 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.3■■□□□ 1.8
SLC25A39-215ENST00000592372 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-215ENST00000592372 PTPRMP28827 1452 aa26.26■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 MADDQ8WXG6 1647 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 MIA2Q96PC5 1412 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 ATP7AQ04656 1500 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 REREQ9P2R6 1566 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-215ENST00000592372 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 AGLP35573 1532 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 A2MP01023 1474 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-215ENST00000592372 TSPY4P0CV99 314 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 TSPY10P0CW01 314 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 PLXNC1O60486 1568 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 ABCC5O15440 1437 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A39-215ENST00000592372 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SLC25A39-215ENST00000592372 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC25A39-215ENST00000592372 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC25A39-215ENST00000592372 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SLC25A39-215ENST00000592372 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC25A39-215ENST00000592372 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC25A39-215ENST00000592372 DAPK1P53355 1430 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 GGT6Q6P531 493 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 KIF3BO15066 747 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-215ENST00000592372 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC25A39-215ENST00000592372 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A39-215ENST00000592372 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC25A39-215ENST00000592372 KIF15Q9NS87 1388 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC25A39-215ENST00000592372 ZMYM3Q14202 1370 aa25.89■■□□□ 1.74
SLC25A39-215ENST00000592372 PTPRKQ15262 1439 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-215ENST00000592372 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-215ENST00000592372 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-215ENST00000592372 C3P01024 1663 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-215ENST00000592372 NCOA1Q15788 1441 aa25.86■■□□□ 1.73
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