RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589686.5

CIRBP-224, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 2

Gene CIRBP, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-224	ENST00000589686	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CIRBP-224	ENST00000589686	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.45	■■■□□ 2.94
CIRBP-224	ENST00000589686	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CIRBP-224	ENST00000589686	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.4	■■■□□ 2.94
CIRBP-224	ENST00000589686	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CIRBP-224	ENST00000589686	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
CIRBP-224	ENST00000589686	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CIRBP-224	ENST00000589686	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CIRBP-224	ENST00000589686	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
CIRBP-224	ENST00000589686	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CIRBP-224	ENST00000589686	ABCC1	P33527	1531 aa		33.34	■■■□□ 2.93
CIRBP-224	ENST00000589686	KDM5C	P41229	1560 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	ATP10A	O60312	1499 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CIRBP-224	ENST00000589686	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIRBP-224	ENST00000589686	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIRBP-224	ENST00000589686	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIRBP-224	ENST00000589686	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIRBP-224	ENST00000589686	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.18	■■■□□ 2.9
CIRBP-224	ENST00000589686	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIRBP-224	ENST00000589686	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	PTPRM	P28827	1452 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	APLP2	Q06481	763 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	MLEC	Q14165	292 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIRBP-224	ENST00000589686	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CIRBP-224	ENST00000589686	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
CIRBP-224	ENST00000589686	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CIRBP-224	ENST00000589686	AGL	P35573	1532 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CIRBP-224	ENST00000589686	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CIRBP-224	ENST00000589686	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CIRBP-224	ENST00000589686	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIRBP-224	ENST00000589686	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIRBP-224	ENST00000589686	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIRBP-224	ENST00000589686	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CIRBP-224	ENST00000589686	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CIRBP-224	ENST00000589686	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIRBP-224	ENST00000589686	A2M	P01023	1474 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CIRBP-224	ENST00000589686	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CIRBP-224	ENST00000589686	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIRBP-224	ENST00000589686	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-224	ENST00000589686	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-224	ENST00000589686	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-224	ENST00000589686	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-224	ENST00000589686	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-224	ENST00000589686	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
CIRBP-224	ENST00000589686	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CIRBP-224	ENST00000589686	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CIRBP-224	ENST00000589686	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CIRBP-224	ENST00000589686	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CIRBP-224	ENST00000589686	GGT6	Q6P531	493 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CIRBP-224	ENST00000589686	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CIRBP-224	ENST00000589686	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CIRBP-224	ENST00000589686	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CIRBP-224	ENST00000589686	C3	P01024	1663 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CIRBP-224	ENST00000589686	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	KIF3B	O15066	747 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	ABCC5	O15440	1437 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CIRBP-224	ENST00000589686	HSPA2	P54652	639 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	DAPK1	P53355	1430 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	NPAT	Q14207	1427 aa		32.51	■■■□□ 2.8
CIRBP-224	ENST00000589686	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CIRBP-224	ENST00000589686	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIRBP-224	ENST00000589686	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.47	■■■□□ 2.79

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