RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589600.5

ILF3-216, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ILF3, Length 839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-216ENST00000589600 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
ILF3-216ENST00000589600 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
ILF3-216ENST00000589600 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.84■■■■□ 3.81
ILF3-216ENST00000589600 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
ILF3-216ENST00000589600 NCOA2Q15596 1464 aa38.81■■■■□ 3.8
ILF3-216ENST00000589600 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.79■■■■□ 3.8
ILF3-216ENST00000589600 RICTORQ6R327 1708 aa38.78■■■■□ 3.8
ILF3-216ENST00000589600 ADGRL1O94910 1474 aa38.78■■■■□ 3.8
ILF3-216ENST00000589600 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.75■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.73■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 RAPGEF3O95398 923 aa38.72■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.71■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.7■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 ABCC1P33527 1531 aa38.7■■■■□ 3.79
ILF3-216ENST00000589600 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.67■■■■□ 3.78
ILF3-216ENST00000589600 APLP2Q06481 763 aa38.67■■■■□ 3.78
ILF3-216ENST00000589600 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.66■■■■□ 3.78
ILF3-216ENST00000589600 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.63■■■■□ 3.78
ILF3-216ENST00000589600 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
ILF3-216ENST00000589600 KDM5CP41229 1560 aa38.57■■■■□ 3.76
ILF3-216ENST00000589600 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.55■■■■□ 3.76
ILF3-216ENST00000589600 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.54■■■■□ 3.76
ILF3-216ENST00000589600 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
ILF3-216ENST00000589600 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.53■■■■□ 3.76
ILF3-216ENST00000589600 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.51■■■■□ 3.76
ILF3-216ENST00000589600 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.5■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.5■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.49■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.47■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 AFAP1Q8N556 730 aa38.46■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.46■■■■□ 3.75
ILF3-216ENST00000589600 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.44■■■■□ 3.74
ILF3-216ENST00000589600 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.44■■■■□ 3.74
ILF3-216ENST00000589600 MBD5Q9P267 1494 aa38.43■■■■□ 3.74
ILF3-216ENST00000589600 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.42■■■■□ 3.74
ILF3-216ENST00000589600 MIA2Q96PC5 1412 aa38.41■■■■□ 3.74
ILF3-216ENST00000589600 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.747e-7■■■□□ 17.3
ILF3-216ENST00000589600 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.38■■■■□ 3.73
ILF3-216ENST00000589600 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.34■■■■□ 3.73
ILF3-216ENST00000589600 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.32■■■■□ 3.73
ILF3-216ENST00000589600 ABCA6Q8N139 1617 aa38.32■■■■□ 3.73
ILF3-216ENST00000589600 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
ILF3-216ENST00000589600 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.31■■■■□ 3.72
ILF3-216ENST00000589600 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.3■■■■□ 3.72
ILF3-216ENST00000589600 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.3■■■■□ 3.72
ILF3-216ENST00000589600 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.29■■■■□ 3.72
ILF3-216ENST00000589600 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.26■■■■□ 3.72
ILF3-216ENST00000589600 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 ATP7AQ04656 1500 aa38.24■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 ATP10AO60312 1499 aa38.24■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 REREQ9P2R6 1566 aa38.2■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.2■■■■□ 3.71
ILF3-216ENST00000589600 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.17■■■■□ 3.7
ILF3-216ENST00000589600 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.14■■■■□ 3.7
ILF3-216ENST00000589600 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.13■■■■□ 3.7
ILF3-216ENST00000589600 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.12■■■■□ 3.69
ILF3-216ENST00000589600 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.12■■■■□ 3.69
ILF3-216ENST00000589600 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.11■■■■□ 3.69
ILF3-216ENST00000589600 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.11■■■■□ 3.69
ILF3-216ENST00000589600 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
ILF3-216ENST00000589600 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.07■■■■□ 3.69
ILF3-216ENST00000589600 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.07■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 PLXNC1O60486 1568 aa38.06■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 ABCC5O15440 1437 aa38.06■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 AGLP35573 1532 aa38.04■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 DAPK1P53355 1430 aa38.03■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.02■■■■□ 3.68
ILF3-216ENST00000589600 A2MP01023 1474 aa38■■■■□ 3.67
ILF3-216ENST00000589600 TSPY4P0CV99 314 aa37.97■■■■□ 3.67
ILF3-216ENST00000589600 TSPY10P0CW01 314 aa37.97■■■■□ 3.67
ILF3-216ENST00000589600 MADDQ8WXG6 1647 aa37.95■■■■□ 3.67
ILF3-216ENST00000589600 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
ILF3-216ENST00000589600 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
ILF3-216ENST00000589600 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
ILF3-216ENST00000589600 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
ILF3-216ENST00000589600 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.85■■■■□ 3.65
ILF3-216ENST00000589600 MLECQ14165 292 aa37.85■■■■□ 3.65
ILF3-216ENST00000589600 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
ILF3-216ENST00000589600 PTPRKQ15262 1439 aa37.83■■■■□ 3.65
ILF3-216ENST00000589600 ADGRL2O95490 1459 aa37.81■■■■□ 3.64
ILF3-216ENST00000589600 PTPRMP28827 1452 aa37.77■■■■□ 3.64
ILF3-216ENST00000589600 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.77■■■■□ 3.64
ILF3-216ENST00000589600 KIF15Q9NS87 1388 aa37.76■■■■□ 3.64
ILF3-216ENST00000589600 NCOA1Q15788 1441 aa37.75■■■■□ 3.63
ILF3-216ENST00000589600 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.74■■■■□ 3.63
ILF3-216ENST00000589600 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
ILF3-216ENST00000589600 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
ILF3-216ENST00000589600 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.71■■■■□ 3.63
ILF3-216ENST00000589600 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.69■■■■□ 3.62
ILF3-216ENST00000589600 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
ILF3-216ENST00000589600 ERBINQ96RT1 1412 aa37.66■■■■□ 3.62
ILF3-216ENST00000589600 KIF3BO15066 747 aa37.65■■■■□ 3.62
ILF3-216ENST00000589600 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.64■■■■□ 3.62
ILF3-216ENST00000589600 ROCK1Q13464 1354 aa37.62■■■■□ 3.61
ILF3-216ENST00000589600 GGT6Q6P531 493 aa37.61■■■■□ 3.61
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