RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589600.5

ILF3-216, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ILF3, Length 839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-216ENST00000589600 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.76■■■■■ 7.16
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ILF3-216ENST00000589600 ABCC9O60706 1549 aa51.62■■■■■ 5.85
ILF3-216ENST00000589600 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.87■■■■■ 5.57
ILF3-216ENST00000589600 NACADO15069 1562 aa49.77■■■■■ 5.56
ILF3-216ENST00000589600 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.76■■■■■ 5.56
ILF3-216ENST00000589600 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.6■■■■■ 5.53
ILF3-216ENST00000589600 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.6■■■■■ 5.53
ILF3-216ENST00000589600 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.48■■■■■ 5.51
ILF3-216ENST00000589600 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.78■■■■■ 5.4
ILF3-216ENST00000589600 SCRIBQ14160 1630 aa48.4■■■■■ 5.34
ILF3-216ENST00000589600 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.37■■■■■ 5.33
ILF3-216ENST00000589600 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.22■■■■■ 5.31
ILF3-216ENST00000589600 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
ILF3-216ENST00000589600 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.2■■■■■ 5.15
ILF3-216ENST00000589600 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
ILF3-216ENST00000589600 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.76■■■■■ 5.08
ILF3-216ENST00000589600 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.56■■■■■ 5.04
ILF3-216ENST00000589600 SMARCA4P51532 1647 aa46.35■■■■■ 5.01
ILF3-216ENST00000589600 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.28■■■■■ 5
ILF3-216ENST00000589600 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.09■■■■■ 4.97
ILF3-216ENST00000589600 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46■■■■■ 4.95
ILF3-216ENST00000589600 NCAPD3P42695 1498 aa45.93■■■■■ 4.94
ILF3-216ENST00000589600 SMARCA2P51531 1590 aa45.92■■■■■ 4.94
ILF3-216ENST00000589600 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.92■■■■■ 4.94
ILF3-216ENST00000589600 HMGXB3Q12766 1538 aa45.76■■■■■ 4.92
ILF3-216ENST00000589600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.61■■■■■ 4.89
ILF3-216ENST00000589600 WIZO95785 1651 aa45.6■■■■■ 4.89
ILF3-216ENST00000589600 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
ILF3-216ENST00000589600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
ILF3-216ENST00000589600 NESP48681 1621 aa44.79■■■■■ 4.76
ILF3-216ENST00000589600 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.68■■■■■ 4.74
ILF3-216ENST00000589600 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.57■■■■■ 4.73
ILF3-216ENST00000589600 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.56■■■■■ 4.72
ILF3-216ENST00000589600 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
ILF3-216ENST00000589600 CFTRP13569 1480 aa44.4■■■■■ 4.7
ILF3-216ENST00000589600 ERCC6Q03468 1493 aa44.4■■■■■ 4.7
ILF3-216ENST00000589600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.29■■■■■ 4.68
ILF3-216ENST00000589600 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.29■■■■■ 4.68
ILF3-216ENST00000589600 PRDM2Q13029 1718 aa44.15■■■■■ 4.66
ILF3-216ENST00000589600 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
ILF3-216ENST00000589600 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.08■■■■■ 4.65
ILF3-216ENST00000589600 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.98■■■■■ 4.63
ILF3-216ENST00000589600 CUX2O14529 1486 aa43.91■■■■■ 4.62
ILF3-216ENST00000589600 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.89■■■■■ 4.62
ILF3-216ENST00000589600 WDR62O43379 1518 aa43.79■■■■■ 4.6
ILF3-216ENST00000589600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
ILF3-216ENST00000589600 TOPBP1Q92547 1522 aa43.43■■■■■ 4.54
ILF3-216ENST00000589600 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.4■■■■■ 4.54
ILF3-216ENST00000589600 ABCC8Q09428 1581 aa43.35■■■■■ 4.53
ILF3-216ENST00000589600 CUX1P39880 1505 aa43.22■■■■■ 4.51
ILF3-216ENST00000589600 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
ILF3-216ENST00000589600 IFT140Q96RY7 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
ILF3-216ENST00000589600 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
ILF3-216ENST00000589600 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43■■■■■ 4.47
ILF3-216ENST00000589600 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.95■■■■■ 4.47
ILF3-216ENST00000589600 SYNJ1O43426 1573 aa42.94■■■■■ 4.46
ILF3-216ENST00000589600 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.93■■■■■ 4.46
ILF3-216ENST00000589600 TOP2BQ02880 1626 aa42.9■■■■■ 4.46
ILF3-216ENST00000589600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
ILF3-216ENST00000589600 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.87■■■■■ 4.45
ILF3-216ENST00000589600 SOGA1O94964 1423 aa42.83■■■■■ 4.45
ILF3-216ENST00000589600 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
ILF3-216ENST00000589600 WDR97A6NE52 1622 aa42.73■■■■■ 4.43
ILF3-216ENST00000589600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.64■■■■■ 4.423e-11■■■□□ 17.8
ILF3-216ENST00000589600 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.6■■■■■ 4.41
ILF3-216ENST00000589600 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
ILF3-216ENST00000589600 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.47■■■■■ 4.39
ILF3-216ENST00000589600 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
ILF3-216ENST00000589600 PBRM1Q86U86 1689 aa42.35■■■■■ 4.37
ILF3-216ENST00000589600 GRIN2BQ13224 1484 aa42.33■■■■■ 4.37
ILF3-216ENST00000589600 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.27■■■■■ 4.36
ILF3-216ENST00000589600 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.24■■■■■ 4.35
ILF3-216ENST00000589600 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
ILF3-216ENST00000589600 CHD1O14646 1710 aa42.17■■■■■ 4.34
ILF3-216ENST00000589600 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.09■■■■■ 4.33
ILF3-216ENST00000589600 SYNJ2O15056 1496 aa42.04■■■■■ 4.32
ILF3-216ENST00000589600 ADAMTS12P58397 1594 aa42.03■■■■■ 4.32
ILF3-216ENST00000589600 OSCARQ8IYS5 282 aa42.03■■■■■ 4.32
ILF3-216ENST00000589600 KIF27Q86VH2 1401 aa42■■■■■ 4.31
ILF3-216ENST00000589600 TRIM41Q8WV44 630 aa41.98■■■■■ 4.31
ILF3-216ENST00000589600 FBLN2P98095 1184 aa41.94■■■■■ 4.3
ILF3-216ENST00000589600 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.88■■■■■ 4.3
ILF3-216ENST00000589600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
ILF3-216ENST00000589600 IGF1RP08069 1367 aa41.85■■■■■ 4.29
ILF3-216ENST00000589600 GRIN2AQ12879 1464 aa41.82■■■■■ 4.29
ILF3-216ENST00000589600 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.8■■■■■ 4.28
ILF3-216ENST00000589600 CUL7Q14999 1698 aa41.75■■■■■ 4.27
ILF3-216ENST00000589600 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.74■■■■■ 4.27
ILF3-216ENST00000589600 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.72■■■■■ 4.27
ILF3-216ENST00000589600 CEP170Q5SW79 1584 aa41.65■■■■■ 4.26
ILF3-216ENST00000589600 NUP160Q12769 1436 aa41.64■■■■■ 4.26
ILF3-216ENST00000589600 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.56■■■■■ 4.24
ILF3-216ENST00000589600 ARHGEF11O15085 1522 aa41.49■■■■■ 4.23
ILF3-216ENST00000589600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.48■■■■■ 4.23
ILF3-216ENST00000589600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.48■■■■■ 4.23
ILF3-216ENST00000589600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.48■■■■■ 4.23
ILF3-216ENST00000589600 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.37■■■■■ 4.21
ILF3-216ENST00000589600 SHROOM2Q13796 1616 aa41.35■■■■■ 4.21
ILF3-216ENST00000589600 EEA1Q15075 1411 aa41.35■■■■■ 4.21
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