RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-208ENST00000589537 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.7■■□□□ 1.86
NFIC-208ENST00000589537 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.7■■□□□ 1.86
NFIC-208ENST00000589537 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.7■■□□□ 1.86
NFIC-208ENST00000589537 PREX2Q70Z35 1606 aa26.65■■□□□ 1.86
NFIC-208ENST00000589537 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.65■■□□□ 1.86
NFIC-208ENST00000589537 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.62■■□□□ 1.85
NFIC-208ENST00000589537 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.59■■□□□ 1.85
NFIC-208ENST00000589537 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
NFIC-208ENST00000589537 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.57■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.57■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.56■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.56■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 KDM5CP41229 1560 aa26.55■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.55■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 ABCC1P33527 1531 aa26.54■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.52■■□□□ 1.84
NFIC-208ENST00000589537 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 ATP10AO60312 1499 aa26.5■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.5■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.49■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.48■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.47■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.47■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 PTPRMP28827 1452 aa26.47■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.47■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.47■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 AFAP1Q8N556 730 aa26.46■■□□□ 1.83
NFIC-208ENST00000589537 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.45■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 MADDQ8WXG6 1647 aa26.45■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.44■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.42■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 REREQ9P2R6 1566 aa26.41■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.41■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.4■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.39■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 TIAM1Q13009 1591 aa26.39■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.39■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NFIC-208ENST00000589537 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.38■■□□□ 1.81
NFIC-208ENST00000589537 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
NFIC-208ENST00000589537 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
NFIC-208ENST00000589537 ABCA6Q8N139 1617 aa26.35■■□□□ 1.81
NFIC-208ENST00000589537 MAP3K1Q13233 1512 aa26.34■■□□□ 1.81
NFIC-208ENST00000589537 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.31■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.31■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 AGLP35573 1532 aa26.31■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 NCOA2Q15596 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 MLECQ14165 292 aa26.3■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.28■■□□□ 1.8
NFIC-208ENST00000589537 ATP7AQ04656 1500 aa26.25■■□□□ 1.79
NFIC-208ENST00000589537 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NFIC-208ENST00000589537 MBD5Q9P267 1494 aa26.21■■□□□ 1.79
NFIC-208ENST00000589537 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.18■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.17■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.17■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.17■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 APLP2Q06481 763 aa26.16■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.16■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 A2MP01023 1474 aa26.15■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 PLXNC1O60486 1568 aa26.15■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.14■■□□□ 1.78
NFIC-208ENST00000589537 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.13■■□□□ 1.77
NFIC-208ENST00000589537 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.11■■□□□ 1.77
NFIC-208ENST00000589537 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.11■■□□□ 1.77
NFIC-208ENST00000589537 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NFIC-208ENST00000589537 MIA2Q96PC5 1412 aa26.1■■□□□ 1.77
NFIC-208ENST00000589537 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.08■■□□□ 1.77
NFIC-208ENST00000589537 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.06■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 MROH2AA6NES4 1674 aa26.03■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 TSPY4P0CV99 314 aa26.03■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 TSPY10P0CW01 314 aa26.03■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 C3P01024 1663 aa26.03■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.02■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
NFIC-208ENST00000589537 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26■■□□□ 1.75
NFIC-208ENST00000589537 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.98■■□□□ 1.75
NFIC-208ENST00000589537 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NFIC-208ENST00000589537 NPATQ14207 1427 aa25.97■■□□□ 1.75
NFIC-208ENST00000589537 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.95■■□□□ 1.74
NFIC-208ENST00000589537 GGT6Q6P531 493 aa25.95■■□□□ 1.74
NFIC-208ENST00000589537 ZMYM3Q14202 1370 aa25.95■■□□□ 1.74
NFIC-208ENST00000589537 HSPA2P54652 639 aa25.94■■□□□ 1.74
NFIC-208ENST00000589537 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NFIC-208ENST00000589537 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.9■■□□□ 1.74
NFIC-208ENST00000589537 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.88■■□□□ 1.73
NFIC-208ENST00000589537 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.88■■□□□ 1.73
NFIC-208ENST00000589537 KIF3BO15066 747 aa25.88■■□□□ 1.73
NFIC-208ENST00000589537 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
NFIC-208ENST00000589537 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.85■■□□□ 1.73
NFIC-208ENST00000589537 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
NFIC-208ENST00000589537 PTPRKQ15262 1439 aa25.82■■□□□ 1.72
NFIC-208ENST00000589537 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.82■■□□□ 1.72
NFIC-208ENST00000589537 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.81■■□□□ 1.72
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