RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-222	ENST00000589235	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		34.3	■■■■□ 3.08
CIRBP-222	ENST00000589235	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.29	■■■■□ 3.08
CIRBP-222	ENST00000589235	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		34.29	■■■■□ 3.08
CIRBP-222	ENST00000589235	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		34.27	■■■■□ 3.08
CIRBP-222	ENST00000589235	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		34.25	■■■■□ 3.07
CIRBP-222	ENST00000589235	PTPRM	P28827	1452 aa		34.23	■■■■□ 3.07
CIRBP-222	ENST00000589235	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		34.23	■■■■□ 3.07
CIRBP-222	ENST00000589235	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIRBP-222	ENST00000589235	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		34.2	■■■■□ 3.06
CIRBP-222	ENST00000589235	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		34.19	■■■■□ 3.06
CIRBP-222	ENST00000589235	AFAP1	Q8N556	730 aa		34.15	■■■■□ 3.06
CIRBP-222	ENST00000589235	ATP10A	O60312	1499 aa		34.14	■■■■□ 3.06
CIRBP-222	ENST00000589235	MADD	Q8WXG6	1647 aa		34.12	■■■■□ 3.05
CIRBP-222	ENST00000589235	MLEC	Q14165	292 aa		34.1	■■■■□ 3.05
CIRBP-222	ENST00000589235	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		34.1	■■■■□ 3.05
CIRBP-222	ENST00000589235	PREX2	Q70Z35	1606 aa		34.08	■■■■□ 3.05
CIRBP-222	ENST00000589235	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		34.07	■■■■□ 3.04
CIRBP-222	ENST00000589235	CEP162	Q5TB80	1403 aa		34.06	■■■■□ 3.04
CIRBP-222	ENST00000589235	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		34.05	■■■■□ 3.04
CIRBP-222	ENST00000589235	KDM5C	P41229	1560 aa		34.04	■■■■□ 3.04
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	34.03	■■■■□ 3.04
CIRBP-222	ENST00000589235	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	34	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		34	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCC1	P33527	1531 aa		33.99	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.98	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.97	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.97	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.97	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.95	■■■■□ 3.03
CIRBP-222	ENST00000589235	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.94	■■■■□ 3.02
CIRBP-222	ENST00000589235	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CIRBP-222	ENST00000589235	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.89	■■■■□ 3.02
CIRBP-222	ENST00000589235	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.89	■■■■□ 3.02
CIRBP-222	ENST00000589235	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.87	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.87	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.87	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.86	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.86	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.85	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.84	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.82	■■■■□ 3.01
CIRBP-222	ENST00000589235	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.81	■■■■□ 3
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.81	■■■■□ 3
CIRBP-222	ENST00000589235	AGL	P35573	1532 aa		33.79	■■■■□ 3
CIRBP-222	ENST00000589235	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.75	■■■□□ 2.99
CIRBP-222	ENST00000589235	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
CIRBP-222	ENST00000589235	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
CIRBP-222	ENST00000589235	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CIRBP-222	ENST00000589235	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CIRBP-222	ENST00000589235	HSPA2	P54652	639 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-222	ENST00000589235	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-222	ENST00000589235	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-222	ENST00000589235	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-222	ENST00000589235	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-222	ENST00000589235	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CIRBP-222	ENST00000589235	A2M	P01023	1474 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CIRBP-222	ENST00000589235	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CIRBP-222	ENST00000589235	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CIRBP-222	ENST00000589235	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CIRBP-222	ENST00000589235	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	APLP2	Q06481	763 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	GGT6	Q6P531	493 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.52	■■■□□ 2.96
CIRBP-222	ENST00000589235	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	C3	P01024	1663 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.45	■■■□□ 2.95
CIRBP-222	ENST00000589235	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CIRBP-222	ENST00000589235	NPAT	Q14207	1427 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CIRBP-222	ENST00000589235	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CIRBP-222	ENST00000589235	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF3B	O15066	747 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CIRBP-222	ENST00000589235	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CIRBP-222	ENST00000589235	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CIRBP-222	ENST00000589235	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
CIRBP-222	ENST00000589235	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CIRBP-222	ENST00000589235	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CIRBP-222	ENST00000589235	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CIRBP-222	ENST00000589235	PTPRT	O14522	1441 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIRBP-222	ENST00000589235	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CIRBP-222	ENST00000589235	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CIRBP-222	ENST00000589235	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIRBP-222	ENST00000589235	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.19	■■■□□ 2.9

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