RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588230.5

CIRBP-217, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-217ENST00000588230 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.69■■■□□ 2.5
CIRBP-217ENST00000588230 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.66■■■□□ 2.5
CIRBP-217ENST00000588230 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.66■■■□□ 2.5
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.65■■■□□ 2.5
CIRBP-217ENST00000588230 PREX2Q70Z35 1606 aa30.65■■■□□ 2.5
CIRBP-217ENST00000588230 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.63■■■□□ 2.49
CIRBP-217ENST00000588230 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.61■■■□□ 2.49
CIRBP-217ENST00000588230 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.61■■■□□ 2.49
CIRBP-217ENST00000588230 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.61■■■□□ 2.49
CIRBP-217ENST00000588230 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.59■■■□□ 2.49
CIRBP-217ENST00000588230 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.58■■■□□ 2.49
CIRBP-217ENST00000588230 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.57■■■□□ 2.48
CIRBP-217ENST00000588230 KDM5CP41229 1560 aa30.55■■■□□ 2.48
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC1P33527 1531 aa30.54■■■□□ 2.48
CIRBP-217ENST00000588230 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.53■■■□□ 2.48
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.52■■■□□ 2.48
CIRBP-217ENST00000588230 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.47■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 MADDQ8WXG6 1647 aa30.47■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.47■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 AFAP1Q8N556 730 aa30.47■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.46■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.46■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.45■■■□□ 2.47
CIRBP-217ENST00000588230 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.45■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 PTPRMP28827 1452 aa30.44■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 ATP10AO60312 1499 aa30.44■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.43■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.4■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.4■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 TIAM1Q13009 1591 aa30.39■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.39■■■□□ 2.46
CIRBP-217ENST00000588230 ABCA6Q8N139 1617 aa30.36■■■□□ 2.45
CIRBP-217ENST00000588230 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.36■■■□□ 2.45
CIRBP-217ENST00000588230 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.36■■■□□ 2.45
CIRBP-217ENST00000588230 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CIRBP-217ENST00000588230 REREQ9P2R6 1566 aa30.33■■■□□ 2.45
CIRBP-217ENST00000588230 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.32■■■□□ 2.44
CIRBP-217ENST00000588230 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.3■■■□□ 2.44
CIRBP-217ENST00000588230 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CIRBP-217ENST00000588230 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CIRBP-217ENST00000588230 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.27■■■□□ 2.44
CIRBP-217ENST00000588230 NCOA2Q15596 1464 aa30.26■■■□□ 2.44
CIRBP-217ENST00000588230 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.25■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 APLP2Q06481 763 aa30.23■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 MLECQ14165 292 aa30.23■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 AGLP35573 1532 aa30.22■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.22■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 MAP3K1Q13233 1512 aa30.22■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 MBD5Q9P267 1494 aa30.2■■■□□ 2.43
CIRBP-217ENST00000588230 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.19■■■□□ 2.42
CIRBP-217ENST00000588230 ATP7AQ04656 1500 aa30.17■■■□□ 2.42
CIRBP-217ENST00000588230 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CIRBP-217ENST00000588230 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CIRBP-217ENST00000588230 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.14■■■□□ 2.42
CIRBP-217ENST00000588230 PLXNC1O60486 1568 aa30.11■■■□□ 2.41
CIRBP-217ENST00000588230 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.1■■■□□ 2.41
CIRBP-217ENST00000588230 A2MP01023 1474 aa30.04■■■□□ 2.4
CIRBP-217ENST00000588230 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
CIRBP-217ENST00000588230 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.02■■■□□ 2.4
CIRBP-217ENST00000588230 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.02■■■□□ 2.4
CIRBP-217ENST00000588230 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CIRBP-217ENST00000588230 ADGBQ8N7X0 1667 aa30■■■□□ 2.39
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.99■■■□□ 2.39
CIRBP-217ENST00000588230 C3P01024 1663 aa29.97■■■□□ 2.39
CIRBP-217ENST00000588230 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.96■■■□□ 2.39
CIRBP-217ENST00000588230 MIA2Q96PC5 1412 aa29.93■■■□□ 2.38
CIRBP-217ENST00000588230 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.93■■■□□ 2.38
CIRBP-217ENST00000588230 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.92■■■□□ 2.38
CIRBP-217ENST00000588230 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.91■■■□□ 2.38
CIRBP-217ENST00000588230 HSPA2P54652 639 aa29.9■■■□□ 2.38
CIRBP-217ENST00000588230 MROH2AA6NES4 1674 aa29.89■■■□□ 2.38
CIRBP-217ENST00000588230 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
CIRBP-217ENST00000588230 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.86■■■□□ 2.37
CIRBP-217ENST00000588230 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CIRBP-217ENST00000588230 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CIRBP-217ENST00000588230 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CIRBP-217ENST00000588230 ZMYM3Q14202 1370 aa29.8■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 TSPY4P0CV99 314 aa29.8■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 TSPY10P0CW01 314 aa29.8■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.79■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 GGT6Q6P531 493 aa29.78■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 NPATQ14207 1427 aa29.78■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.78■■■□□ 2.36
CIRBP-217ENST00000588230 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.76■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.75■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 PTPRKQ15262 1439 aa29.72■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.72■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC5O15440 1437 aa29.71■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 KIF3BO15066 747 aa29.71■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.7■■■□□ 2.35
CIRBP-217ENST00000588230 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.7■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 STRCQ7RTU9 1775 aa29.69■■■□□ 2.34
CIRBP-217ENST00000588230 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
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