RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587721.1

RDH13-209, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 4

Gene RDH13, Length 731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-209ENST00000587721 CLIP1P30622 1438 aa22.5■■□□□ 1.19
RDH13-209ENST00000587721 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RDH13-209ENST00000587721 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.47■■□□□ 1.19
RDH13-209ENST00000587721 KIF14Q15058 1648 aa22.45■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.43■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 MLECQ14165 292 aa22.43■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.42■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.41■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.41■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 ATP10AO60312 1499 aa22.41■■□□□ 1.18
RDH13-209ENST00000587721 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.39■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.39■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.38■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.38■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 AFAP1Q8N556 730 aa22.35■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 FBXO41Q8TF61 875 aa22.34■■□□□ 1.17
RDH13-209ENST00000587721 HSPA2P54652 639 aa22.3■■□□□ 1.16
RDH13-209ENST00000587721 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.3■■□□□ 1.16
RDH13-209ENST00000587721 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.29■■□□□ 1.16
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RDH13-209ENST00000587721 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.28■■□□□ 1.16
RDH13-209ENST00000587721 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.27■■□□□ 1.16
RDH13-209ENST00000587721 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.27■■□□□ 1.16
RDH13-209ENST00000587721 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RDH13-209ENST00000587721 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.25■■□□□ 1.15
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RDH13-209ENST00000587721 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.23■■□□□ 1.15
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RDH13-209ENST00000587721 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
RDH13-209ENST00000587721 ABCC1P33527 1531 aa22.21■■□□□ 1.15
RDH13-209ENST00000587721 REREQ9P2R6 1566 aa22.21■■□□□ 1.15
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RDH13-209ENST00000587721 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.2■■□□□ 1.14
RDH13-209ENST00000587721 AGLP35573 1532 aa22.16■■□□□ 1.14
RDH13-209ENST00000587721 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.15■■□□□ 1.14
RDH13-209ENST00000587721 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.14■■□□□ 1.14
RDH13-209ENST00000587721 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.14■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.14■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.13■■□□□ 1.13
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RDH13-209ENST00000587721 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.12■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.1■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.1■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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RDH13-209ENST00000587721 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.08■■□□□ 1.13
RDH13-209ENST00000587721 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.07■■□□□ 1.12
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RDH13-209ENST00000587721 TSPY10P0CW01 314 aa21.81■■□□□ 1.08
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RDH13-209ENST00000587721 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.78■■□□□ 1.08
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RDH13-209ENST00000587721 PLA2R1Q13018 1463 aa21.77■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.76■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.76■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.75■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.75■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.73■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RDH13-209ENST00000587721 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.72■■□□□ 1.07
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