RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGAP5Q13017 1502 aa48.99■■■■■ 5.43
GIPC1-205ENST00000586027 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.94■■■■■ 5.43
GIPC1-205ENST00000586027 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa48.93■■■■■ 5.42
GIPC1-205ENST00000586027 AKNAQ7Z591 1439 aa48.92■■■■■ 5.42
GIPC1-205ENST00000586027 CFAP74Q9C0B2 1584 aa48.9■■■■■ 5.42
GIPC1-205ENST00000586027 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
GIPC1-205ENST00000586027 KDM6BO15054 1643 aa48.88■■■■■ 5.42
GIPC1-205ENST00000586027 PHLDB1Q86UU1 1377 aa48.88■■■■■ 5.42
GIPC1-205ENST00000586027 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
GIPC1-205ENST00000586027 ITSN2Q9NZM3 1697 aa48.84■■■■■ 5.41
GIPC1-205ENST00000586027 ADGRL1O94910 1474 aa48.78■■■■■ 5.4
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP48.77■■■■■ 5.4
GIPC1-205ENST00000586027 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa48.76■■■■■ 5.4
GIPC1-205ENST00000586027 MYOM3Q5VTT5 1437 aa48.76■■■■■ 5.4
GIPC1-205ENST00000586027 SCAPERQ9BY12 1400 aa48.73■■■■■ 5.39
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.71■■■■■ 5.39
GIPC1-205ENST00000586027 ABCC1P33527 1531 aa48.7■■■■■ 5.39
GIPC1-205ENST00000586027 RAPGEF3O95398 923 aa48.69■■■■■ 5.39
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa48.69■■■■■ 5.38
GIPC1-205ENST00000586027 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
GIPC1-205ENST00000586027 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa48.65■■■■■ 5.38
GIPC1-205ENST00000586027 MIA2Q96PC5 1412 aa48.62■■■■■ 5.37
GIPC1-205ENST00000586027 POGZQ7Z3K3 1410 aa48.6■■■■■ 5.37
GIPC1-205ENST00000586027 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.6■■■■■ 5.37
GIPC1-205ENST00000586027 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.59■■■■■ 5.37
GIPC1-205ENST00000586027 RICTORQ6R327 1708 aa48.59■■■■■ 5.37
GIPC1-205ENST00000586027 FGD6Q6ZV73 1430 aa48.57■■■■■ 5.37
GIPC1-205ENST00000586027 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.56■■■■■ 5.36
GIPC1-205ENST00000586027 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.56■■■■■ 5.36
GIPC1-205ENST00000586027 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.55■■■■■ 5.36
GIPC1-205ENST00000586027 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa48.55■■■■■ 5.36
GIPC1-205ENST00000586027 AFAP1Q8N556 730 aa48.51■■■■■ 5.36
GIPC1-205ENST00000586027 MBD5Q9P267 1494 aa48.49■■■■■ 5.35
GIPC1-205ENST00000586027 PTPN23Q9H3S7 1636 aa48.47■■■■■ 5.35
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa48.47■■■■■ 5.35
GIPC1-205ENST00000586027 KDM5CP41229 1560 aa48.42■■■■■ 5.34
GIPC1-205ENST00000586027 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa48.42■■■■■ 5.34
GIPC1-205ENST00000586027 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGEF5Q12774 1597 aa48.31■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48.3■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 YEATS2Q9ULM3 1422 aa48.29■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 MAGI2Q86UL8 1455 aa48.26■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 MLH3Q9UHC1 1453 aa48.26■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 HECW2Q9P2P5 1572 aa48.26■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
GIPC1-205ENST00000586027 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa48.24■■■■■ 5.31
GIPC1-205ENST00000586027 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
GIPC1-205ENST00000586027 RSPH4AQ5TD94 716 aa48.22■■■■■ 5.31
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa48.21■■■■■ 5.31
GIPC1-205ENST00000586027 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
GIPC1-205ENST00000586027 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa48.18■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 ABCC5O15440 1437 aa48.18■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.17■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 MYT1LQ9UL68 1186 aa48.16■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 ATP7AQ04656 1500 aa48.14■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 DAPK1P53355 1430 aa48.14■■■■■ 5.3
GIPC1-205ENST00000586027 ABCA6Q8N139 1617 aa48.11■■■■■ 5.29
GIPC1-205ENST00000586027 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa48.1■■■■■ 5.29
GIPC1-205ENST00000586027 TSPY4P0CV99 314 aa48.08■■■■■ 5.29
GIPC1-205ENST00000586027 TSPY10P0CW01 314 aa48.08■■■■■ 5.29
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GIPC1-205ENST00000586027 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa48.07■■■■■ 5.29
GIPC1-205ENST00000586027 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.06■■■■■ 5.28
GIPC1-205ENST00000586027 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.05■■■■■ 5.28
GIPC1-205ENST00000586027 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.04■■■■■ 5.28
GIPC1-205ENST00000586027 ATP10AO60312 1499 aa48.04■■■■■ 5.28
GIPC1-205ENST00000586027 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.02■■■■■ 5.28
GIPC1-205ENST00000586027 PTPRKQ15262 1439 aa47.97■■■■■ 5.27
GIPC1-205ENST00000586027 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa47.96■■■■■ 5.27
GIPC1-205ENST00000586027 CHIC2Q9UKJ5 165 aa47.93■■■■■ 5.26
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GIPC1-205ENST00000586027 A2MP01023 1474 aa47.85■■■■■ 5.25
GIPC1-205ENST00000586027 ADGRL2O95490 1459 aa47.8■■■■■ 5.24
GIPC1-205ENST00000586027 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP47.8■■■■■ 5.24
GIPC1-205ENST00000586027 NCOA1Q15788 1441 aa47.78■■■■■ 5.24
GIPC1-205ENST00000586027 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.77■■■■■ 5.24
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GIPC1-205ENST00000586027 KIF15Q9NS87 1388 aa47.76■■■■■ 5.24
GIPC1-205ENST00000586027 AGLP35573 1532 aa47.74■■■■■ 5.23
GIPC1-205ENST00000586027 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.67■■■■■ 5.22
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GIPC1-205ENST00000586027 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.64■■■■■ 5.22
GIPC1-205ENST00000586027 MLECQ14165 292 aa47.63■■■■■ 5.22
GIPC1-205ENST00000586027 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.58■■■■■ 5.21
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GIPC1-205ENST00000586027 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
GIPC1-205ENST00000586027 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa47.47■■■■■ 5.19
GIPC1-205ENST00000586027 GGT6Q6P531 493 aa47.47■■■■■ 5.19
GIPC1-205ENST00000586027 MADDQ8WXG6 1647 aa47.44■■■■■ 5.19
GIPC1-205ENST00000586027 NAIPQ13075 1403 aa47.41■■■■■ 5.18
GIPC1-205ENST00000586027 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
GIPC1-205ENST00000586027 HFM1A2PYH4 1435 aa47.37■■■■■ 5.17
GIPC1-205ENST00000586027 MROH1Q8NDA8 1641 aa47.36■■■■■ 5.17
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