RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584783.1

AP006261.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP006261.1, Length 668 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP006261.1-201ENST00000584783 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
AP006261.1-201ENST00000584783 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.64■■■■■ 4.58
AP006261.1-201ENST00000584783 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.63■■■■■ 4.57
AP006261.1-201ENST00000584783 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.62■■■■■ 4.57
AP006261.1-201ENST00000584783 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.62■■■■■ 4.57
AP006261.1-201ENST00000584783 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.61■■■■■ 4.57
AP006261.1-201ENST00000584783 PTPRMP28827 1452 aa43.57■■■■■ 4.57
AP006261.1-201ENST00000584783 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.55■■■■■ 4.56
AP006261.1-201ENST00000584783 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.52■■■■■ 4.56
AP006261.1-201ENST00000584783 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.49■■■■■ 4.55
AP006261.1-201ENST00000584783 MADDQ8WXG6 1647 aa43.46■■■■■ 4.55
AP006261.1-201ENST00000584783 ATP10AO60312 1499 aa43.4■■■■■ 4.54
AP006261.1-201ENST00000584783 PREX2Q70Z35 1606 aa43.4■■■■■ 4.54
AP006261.1-201ENST00000584783 KDM5CP41229 1560 aa43.38■■■■■ 4.54
AP006261.1-201ENST00000584783 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.37■■■■■ 4.53
AP006261.1-201ENST00000584783 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.35■■■■■ 4.53
AP006261.1-201ENST00000584783 AFAP1Q8N556 730 aa43.29■■■■■ 4.52
AP006261.1-201ENST00000584783 ABCC1P33527 1531 aa43.28■■■■■ 4.52
AP006261.1-201ENST00000584783 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
AP006261.1-201ENST00000584783 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.26■■■■■ 4.52
AP006261.1-201ENST00000584783 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.25■■■■■ 4.51
AP006261.1-201ENST00000584783 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.21■■■■■ 4.51
AP006261.1-201ENST00000584783 CEP162Q5TB80 1403 aa43.21■■■■■ 4.51
AP006261.1-201ENST00000584783 REREQ9P2R6 1566 aa43.2■■■■■ 4.51
AP006261.1-201ENST00000584783 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.17■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.17■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.16■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 MLECQ14165 292 aa43.16■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.16■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.16■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.15■■■■■ 4.5
AP006261.1-201ENST00000584783 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.12■■■■■ 4.49
AP006261.1-201ENST00000584783 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.12■■■■■ 4.49
AP006261.1-201ENST00000584783 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
AP006261.1-201ENST00000584783 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.08■■■■■ 4.49
AP006261.1-201ENST00000584783 ABCA6Q8N139 1617 aa43.06■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.05■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.04■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 AGLP35573 1532 aa43.04■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.04■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
AP006261.1-201ENST00000584783 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.99■■■■■ 4.47
AP006261.1-201ENST00000584783 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.95■■■■■ 4.47
AP006261.1-201ENST00000584783 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.93■■■■■ 4.46
AP006261.1-201ENST00000584783 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
AP006261.1-201ENST00000584783 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
AP006261.1-201ENST00000584783 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.88■■■■■ 4.45
AP006261.1-201ENST00000584783 TIAM1Q13009 1591 aa42.87■■■■■ 4.45
AP006261.1-201ENST00000584783 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
AP006261.1-201ENST00000584783 ATP7AQ04656 1500 aa42.82■■■■■ 4.45
AP006261.1-201ENST00000584783 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.8■■■■■ 4.44
AP006261.1-201ENST00000584783 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.8■■■■■ 4.44
AP006261.1-201ENST00000584783 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
AP006261.1-201ENST00000584783 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.77■■■■■ 4.44
AP006261.1-201ENST00000584783 HSPA2P54652 639 aa42.77■■■■■ 4.44
AP006261.1-201ENST00000584783 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
AP006261.1-201ENST00000584783 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
AP006261.1-201ENST00000584783 NCOA2Q15596 1464 aa42.73■■■■■ 4.43
AP006261.1-201ENST00000584783 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.72■■■■■ 4.43
AP006261.1-201ENST00000584783 MBD5Q9P267 1494 aa42.71■■■■■ 4.43
AP006261.1-201ENST00000584783 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.7■■■■■ 4.43
AP006261.1-201ENST00000584783 A2MP01023 1474 aa42.69■■■■■ 4.42
AP006261.1-201ENST00000584783 PLXNC1O60486 1568 aa42.69■■■■■ 4.42
AP006261.1-201ENST00000584783 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
AP006261.1-201ENST00000584783 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
AP006261.1-201ENST00000584783 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.66■■■■■ 4.42
AP006261.1-201ENST00000584783 C3P01024 1663 aa42.64■■■■■ 4.42
AP006261.1-201ENST00000584783 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.63■■■■■ 4.41
AP006261.1-201ENST00000584783 MAP3K1Q13233 1512 aa42.61■■■■■ 4.41
AP006261.1-201ENST00000584783 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.6■■■■■ 4.41
AP006261.1-201ENST00000584783 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.59■■■■■ 4.41
AP006261.1-201ENST00000584783 MROH2AA6NES4 1674 aa42.58■■■■■ 4.41
AP006261.1-201ENST00000584783 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.57■■■■■ 4.41
AP006261.1-201ENST00000584783 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.56■■■■■ 4.4
AP006261.1-201ENST00000584783 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.56■■■■■ 4.4
AP006261.1-201ENST00000584783 NPATQ14207 1427 aa42.54■■■■■ 4.4
AP006261.1-201ENST00000584783 FBXO41Q8TF61 875 aa42.54■■■■■ 4.4
AP006261.1-201ENST00000584783 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.5■■■■■ 4.39
AP006261.1-201ENST00000584783 ZMYM3Q14202 1370 aa42.5■■■■■ 4.39
AP006261.1-201ENST00000584783 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
AP006261.1-201ENST00000584783 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.45■■■■■ 4.39
AP006261.1-201ENST00000584783 GGT6Q6P531 493 aa42.43■■■■■ 4.38
AP006261.1-201ENST00000584783 TSPY4P0CV99 314 aa42.37■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 TSPY10P0CW01 314 aa42.37■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 MIA2Q96PC5 1412 aa42.37■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.35■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 STRCQ7RTU9 1775 aa42.32■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.32■■■■■ 4.37
AP006261.1-201ENST00000584783 PTPRTO14522 1441 aa42.29■■■■■ 4.36
AP006261.1-201ENST00000584783 PTPRKQ15262 1439 aa42.29■■■■■ 4.36
AP006261.1-201ENST00000584783 APLP2Q06481 763 aa42.29■■■■■ 4.36
AP006261.1-201ENST00000584783 KIF3BO15066 747 aa42.26■■■■■ 4.36
AP006261.1-201ENST00000584783 CERKQ8TCT0 537 aa42.25■■■■■ 4.35
AP006261.1-201ENST00000584783 NCOA1Q15788 1441 aa42.25■■■■■ 4.35
AP006261.1-201ENST00000584783 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.24■■■■■ 4.35
AP006261.1-201ENST00000584783 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.2■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms