RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.45■□□□□ 0.7
SNHG25-201ENST00000580828 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.45■□□□□ 0.7
SNHG25-201ENST00000580828 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.44■□□□□ 0.7
SNHG25-201ENST00000580828 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
SNHG25-201ENST00000580828 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.41■□□□□ 0.7
SNHG25-201ENST00000580828 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.4■□□□□ 0.7
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.39■□□□□ 0.69
SNHG25-201ENST00000580828 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.39■□□□□ 0.69
SNHG25-201ENST00000580828 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.38■□□□□ 0.69
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SNHG25-201ENST00000580828 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
SNHG25-201ENST00000580828 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.34■□□□□ 0.69
SNHG25-201ENST00000580828 ATP10AO60312 1499 aa19.34■□□□□ 0.69
SNHG25-201ENST00000580828 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.33■□□□□ 0.69
SNHG25-201ENST00000580828 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.33■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.32■□□□□ 0.68
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SNHG25-201ENST00000580828 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.3■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.3■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.3■□□□□ 0.68
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SNHG25-201ENST00000580828 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.29■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.29■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.29■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.27■□□□□ 0.68
SNHG25-201ENST00000580828 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.27■□□□□ 0.67
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SNHG25-201ENST00000580828 MADDQ8WXG6 1647 aa19.25■□□□□ 0.67
SNHG25-201ENST00000580828 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.24■□□□□ 0.67
SNHG25-201ENST00000580828 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
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SNHG25-201ENST00000580828 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.23■□□□□ 0.67
SNHG25-201ENST00000580828 TIAM1Q13009 1591 aa19.22■□□□□ 0.67
SNHG25-201ENST00000580828 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.22■□□□□ 0.67
SNHG25-201ENST00000580828 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SNHG25-201ENST00000580828 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.2■□□□□ 0.66
SNHG25-201ENST00000580828 REREQ9P2R6 1566 aa19.2■□□□□ 0.66
SNHG25-201ENST00000580828 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.2■□□□□ 0.66
SNHG25-201ENST00000580828 MAP3K1Q13233 1512 aa19.2■□□□□ 0.66
SNHG25-201ENST00000580828 NCOA2Q15596 1464 aa19.19■□□□□ 0.66
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
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SNHG25-201ENST00000580828 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
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SNHG25-201ENST00000580828 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SNHG25-201ENST00000580828 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.1■□□□□ 0.65
SNHG25-201ENST00000580828 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.09■□□□□ 0.65
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SNHG25-201ENST00000580828 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.05■□□□□ 0.64
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SNHG25-201ENST00000580828 TSPY10P0CW01 314 aa19.04■□□□□ 0.64
SNHG25-201ENST00000580828 MIA2Q96PC5 1412 aa19.04■□□□□ 0.64
SNHG25-201ENST00000580828 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.04■□□□□ 0.64
SNHG25-201ENST00000580828 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.02■□□□□ 0.64
SNHG25-201ENST00000580828 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.02■□□□□ 0.64
SNHG25-201ENST00000580828 PLXNC1O60486 1568 aa19.02■□□□□ 0.63
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SNHG25-201ENST00000580828 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.01■□□□□ 0.63
SNHG25-201ENST00000580828 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SNHG25-201ENST00000580828 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.99■□□□□ 0.63
SNHG25-201ENST00000580828 HSPA2P54652 639 aa18.98■□□□□ 0.63
SNHG25-201ENST00000580828 GGT6Q6P531 493 aa18.98■□□□□ 0.63
SNHG25-201ENST00000580828 ZMYM3Q14202 1370 aa18.95■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.94■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 C3P01024 1663 aa18.94■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.93■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 KIF3BO15066 747 aa18.93■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 MROH2AA6NES4 1674 aa18.92■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 NPATQ14207 1427 aa18.91■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.9■□□□□ 0.62
SNHG25-201ENST00000580828 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.89■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.86■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.85■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.85■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.85■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 ABCC5O15440 1437 aa18.84■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 PTPRKQ15262 1439 aa18.84■□□□□ 0.61
SNHG25-201ENST00000580828 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.84■□□□□ 0.61
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