RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569439.5

RGL3-216, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 3, human

TSL 2

Gene RGL3, Length 973 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL3-216	ENST00000569439	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RGL3-216	ENST00000569439	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RGL3-216	ENST00000569439	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RGL3-216	ENST00000569439	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RGL3-216	ENST00000569439	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
RGL3-216	ENST00000569439	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
RGL3-216	ENST00000569439	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RGL3-216	ENST00000569439	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RGL3-216	ENST00000569439	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RGL3-216	ENST00000569439	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RGL3-216	ENST00000569439	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	ABCC1	P33527	1531 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RGL3-216	ENST00000569439	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RGL3-216	ENST00000569439	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RGL3-216	ENST00000569439	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.87	■■■□□ 2.69
RGL3-216	ENST00000569439	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RGL3-216	ENST00000569439	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RGL3-216	ENST00000569439	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RGL3-216	ENST00000569439	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RGL3-216	ENST00000569439	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	KDM5C	P41229	1560 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.77	■■■□□ 2.68
RGL3-216	ENST00000569439	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RGL3-216	ENST00000569439	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RGL3-216	ENST00000569439	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RGL3-216	ENST00000569439	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
RGL3-216	ENST00000569439	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RGL3-216	ENST00000569439	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RGL3-216	ENST00000569439	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RGL3-216	ENST00000569439	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RGL3-216	ENST00000569439	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RGL3-216	ENST00000569439	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RGL3-216	ENST00000569439	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	ATP10A	O60312	1499 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RGL3-216	ENST00000569439	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
RGL3-216	ENST00000569439	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
RGL3-216	ENST00000569439	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RGL3-216	ENST00000569439	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RGL3-216	ENST00000569439	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.48	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.47	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.46	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
RGL3-216	ENST00000569439	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.44	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	ABCC5	O15440	1437 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	DAPK1	P53355	1430 aa		31.42	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	A2M	P01023	1474 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	MLEC	Q14165	292 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.4	■■■□□ 2.62
RGL3-216	ENST00000569439	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RGL3-216	ENST00000569439	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.38	■■■□□ 2.61
RGL3-216	ENST00000569439	AGL	P35573	1532 aa		31.37	■■■□□ 2.61
RGL3-216	ENST00000569439	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.35	■■■□□ 2.61
RGL3-216	ENST00000569439	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
RGL3-216	ENST00000569439	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RGL3-216	ENST00000569439	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		31.29	■■■□□ 2.6
RGL3-216	ENST00000569439	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
RGL3-216	ENST00000569439	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
RGL3-216	ENST00000569439	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
RGL3-216	ENST00000569439	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.25	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	KIF15	Q9NS87	1388 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	ITGAE	P38570	1179 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RGL3-216	ENST00000569439	ADGRL2	O95490	1459 aa		31.2	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	PTPRM	P28827	1452 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	KIF3B	O15066	747 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	GGT6	Q6P531	493 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.16	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
RGL3-216	ENST00000569439	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.12	■■■□□ 2.57
RGL3-216	ENST00000569439	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		31.12	■■■□□ 2.57

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