RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567895.5

TRAPPC2L-213, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, human

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 854 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.66	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.64	■■■□□ 2.98
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.57	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.54	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ABCC1	P33527	1531 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KDM5C	P41229	1560 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	APLP2	Q06481	763 aa		33.46	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.44	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.43	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.42	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ATP10A	O60312	1499 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.2	■■■□□ 2.91
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MLEC	Q14165	292 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PTPRM	P28827	1452 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	AGL	P35573	1532 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	A2M	P01023	1474 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.95	■■■□□ 2.87
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ABCC5	O15440	1437 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	GGT6	Q6P531	493 aa		32.86	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.85	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DAPK1	P53355	1430 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KIF3B	O15066	747 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	C3	P01024	1663 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms