RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.43■■■■■ 4.22
SPNS1-209ENST00000567771 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.41■■■■■ 4.22
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRMP28827 1452 aa41.41■■■■■ 4.22
SPNS1-209ENST00000567771 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.4■■■■■ 4.22
SPNS1-209ENST00000567771 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.39■■■■■ 4.22
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.38■■■■■ 4.21
SPNS1-209ENST00000567771 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.37■■■■■ 4.21
SPNS1-209ENST00000567771 MADDQ8WXG6 1647 aa41.33■■■■■ 4.21
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.32■■■■■ 4.2
SPNS1-209ENST00000567771 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.3■■■■■ 4.2
SPNS1-209ENST00000567771 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.27■■■■■ 4.2
SPNS1-209ENST00000567771 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.21■■■■■ 4.19
SPNS1-209ENST00000567771 AFAP1Q8N556 730 aa41.2■■■■■ 4.19
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.19■■■■■ 4.18
SPNS1-209ENST00000567771 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SPNS1-209ENST00000567771 ATP10AO60312 1499 aa41.17■■■■■ 4.18
SPNS1-209ENST00000567771 PREX2Q70Z35 1606 aa41.15■■■■■ 4.18
SPNS1-209ENST00000567771 MLECQ14165 292 aa41.15■■■■■ 4.18
SPNS1-209ENST00000567771 KDM5CP41229 1560 aa41.12■■■■■ 4.17
SPNS1-209ENST00000567771 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.11■■■■■ 4.17
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.07■■■■■ 4.16
SPNS1-209ENST00000567771 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.06■■■■■ 4.16
SPNS1-209ENST00000567771 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.05■■■■■ 4.16
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC1P33527 1531 aa41.05■■■■■ 4.16
SPNS1-209ENST00000567771 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.04■■■■■ 4.16
SPNS1-209ENST00000567771 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.04■■■■■ 4.16
SPNS1-209ENST00000567771 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.98■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 CEP162Q5TB80 1403 aa40.98■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.98■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.97■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.97■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.97■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
SPNS1-209ENST00000567771 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SPNS1-209ENST00000567771 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.92■■■■■ 4.14
SPNS1-209ENST00000567771 ABCA6Q8N139 1617 aa40.91■■■■■ 4.14
SPNS1-209ENST00000567771 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.89■■■■■ 4.14
SPNS1-209ENST00000567771 REREQ9P2R6 1566 aa40.87■■■■■ 4.13
SPNS1-209ENST00000567771 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.86■■■■■ 4.13
SPNS1-209ENST00000567771 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
SPNS1-209ENST00000567771 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.83■■■■■ 4.13
SPNS1-209ENST00000567771 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.82■■■■■ 4.13
SPNS1-209ENST00000567771 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.82■■■■■ 4.13
SPNS1-209ENST00000567771 HSPA2P54652 639 aa40.8■■■■■ 4.12
SPNS1-209ENST00000567771 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SPNS1-209ENST00000567771 AGLP35573 1532 aa40.77■■■■■ 4.12
SPNS1-209ENST00000567771 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.76■■■■■ 4.12
SPNS1-209ENST00000567771 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.75■■■■■ 4.11
SPNS1-209ENST00000567771 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.75■■■■■ 4.11
SPNS1-209ENST00000567771 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
SPNS1-209ENST00000567771 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.72■■■■■ 4.11
SPNS1-209ENST00000567771 TIAM1Q13009 1591 aa40.69■■■■■ 4.11
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SPNS1-209ENST00000567771 ATP7AQ04656 1500 aa40.62■■■■■ 4.09
SPNS1-209ENST00000567771 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
SPNS1-209ENST00000567771 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.59■■■■■ 4.09
SPNS1-209ENST00000567771 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
SPNS1-209ENST00000567771 MBD5Q9P267 1494 aa40.54■■■■■ 4.08
SPNS1-209ENST00000567771 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.54■■■■■ 4.08
SPNS1-209ENST00000567771 C3P01024 1663 aa40.53■■■■■ 4.08
SPNS1-209ENST00000567771 NCOA2Q15596 1464 aa40.53■■■■■ 4.08
SPNS1-209ENST00000567771 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
SPNS1-209ENST00000567771 A2MP01023 1474 aa40.5■■■■■ 4.07
SPNS1-209ENST00000567771 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.5■■■■■ 4.07
SPNS1-209ENST00000567771 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.5■■■■■ 4.07
SPNS1-209ENST00000567771 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
SPNS1-209ENST00000567771 PLXNC1O60486 1568 aa40.47■■■■■ 4.07
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO41Q8TF61 875 aa40.43■■■■■ 4.06
SPNS1-209ENST00000567771 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.39■■■■■ 4.06
SPNS1-209ENST00000567771 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.39■■■■■ 4.06
SPNS1-209ENST00000567771 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.39■■■■■ 4.06
SPNS1-209ENST00000567771 GGT6Q6P531 493 aa40.37■■■■■ 4.05
SPNS1-209ENST00000567771 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.37■■■■■ 4.05
SPNS1-209ENST00000567771 ZMYM3Q14202 1370 aa40.36■■■■■ 4.05
SPNS1-209ENST00000567771 MROH2AA6NES4 1674 aa40.34■■■■■ 4.05
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.33■■■■■ 4.05
SPNS1-209ENST00000567771 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.3■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 STRCQ7RTU9 1775 aa40.29■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 MAP3K1Q13233 1512 aa40.27■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 NPATQ14207 1427 aa40.27■■■■■ 4.04
SPNS1-209ENST00000567771 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.24■■■■■ 4.03
SPNS1-209ENST00000567771 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.23■■■■■ 4.03
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.2■■■■■ 4.03
SPNS1-209ENST00000567771 CERKQ8TCT0 537 aa40.18■■■■■ 4.02
SPNS1-209ENST00000567771 TSPY4P0CV99 314 aa40.17■■■■■ 4.02
SPNS1-209ENST00000567771 TSPY10P0CW01 314 aa40.17■■■■■ 4.02
SPNS1-209ENST00000567771 KIF3BO15066 747 aa40.16■■■■■ 4.02
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRKQ15262 1439 aa40.16■■■■■ 4.02
SPNS1-209ENST00000567771 NCOA1Q15788 1441 aa40.1■■■■■ 4.01
SPNS1-209ENST00000567771 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.1■■■■■ 4.01
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRTO14522 1441 aa40.09■■■■■ 4.01
SPNS1-209ENST00000567771 MIA2Q96PC5 1412 aa40.08■■■■■ 4.01
SPNS1-209ENST00000567771 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.05■■■■■ 4
SPNS1-209ENST00000567771 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.05■■■■■ 4
SPNS1-209ENST00000567771 APLP2Q06481 763 aa40.03■■■■■ 4
SPNS1-209ENST00000567771 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.01■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms