RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.35■■■■■ 7.73
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SPNS1-209ENST00000567771 ABCC9O60706 1549 aa56.43■■■■■ 6.62
SPNS1-209ENST00000567771 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.8■■■■■ 6.2
SPNS1-209ENST00000567771 NACADO15069 1562 aa53.51■■■■■ 6.16
SPNS1-209ENST00000567771 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.41■■■■■ 6.14
SPNS1-209ENST00000567771 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.87■■■■■ 6.05
SPNS1-209ENST00000567771 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.72■■■■■ 6.03
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SPNS1-209ENST00000567771 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.57■■■■■ 6.01
SPNS1-209ENST00000567771 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.56■■■■■ 6.01
SPNS1-209ENST00000567771 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.31■■■■■ 5.96
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SPNS1-209ENST00000567771 SCRIBQ14160 1630 aa51.69■■■■■ 5.87
SPNS1-209ENST00000567771 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.53■■■■■ 5.84
SPNS1-209ENST00000567771 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.97■■■■■ 5.75
SPNS1-209ENST00000567771 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.94■■■■■ 5.74
SPNS1-209ENST00000567771 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.79■■■■■ 5.72
SPNS1-209ENST00000567771 NCAPD3P42695 1498 aa49.43■■■■■ 5.5
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SPNS1-209ENST00000567771 SMARCA4P51532 1647 aa49.33■■■■■ 5.49
SPNS1-209ENST00000567771 SMARCA2P51531 1590 aa49.17■■■■■ 5.46
SPNS1-209ENST00000567771 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.13■■■■■ 5.46
SPNS1-209ENST00000567771 HMGXB3Q12766 1538 aa49.05■■■■■ 5.44
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SPNS1-209ENST00000567771 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.84■■■■■ 5.41
SPNS1-209ENST00000567771 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.84■■■■■ 5.41
SPNS1-209ENST00000567771 ERCC6Q03468 1493 aa48.67■■■■■ 5.38
SPNS1-209ENST00000567771 NESP48681 1621 aa48.58■■■■■ 5.37
SPNS1-209ENST00000567771 CUX2O14529 1486 aa48.47■■■■■ 5.35
SPNS1-209ENST00000567771 WIZO95785 1651 aa48.24■■■■■ 5.31
SPNS1-209ENST00000567771 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.23■■■■■ 5.31
SPNS1-209ENST00000567771 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.14■■■■■ 5.3
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SPNS1-209ENST00000567771 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.96■■■■■ 5.27
SPNS1-209ENST00000567771 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.95■■■■■ 5.27
SPNS1-209ENST00000567771 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.9■■■■■ 5.26
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SPNS1-209ENST00000567771 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.53■■■■■ 5.2
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SPNS1-209ENST00000567771 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.4■■■■■ 5.18
SPNS1-209ENST00000567771 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.4■■■■■ 5.18
SPNS1-209ENST00000567771 WDR62O43379 1518 aa47.4■■■■■ 5.18
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.14■■■■■ 5.14
SPNS1-209ENST00000567771 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
SPNS1-209ENST00000567771 PRDM2Q13029 1718 aa46.92■■■■■ 5.1
SPNS1-209ENST00000567771 TOPBP1Q92547 1522 aa46.54■■■■■ 5.04
SPNS1-209ENST00000567771 IFT140Q96RY7 1462 aa46.45■■■■■ 5.03
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC8Q09428 1581 aa46.43■■■■■ 5.02
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.02
SPNS1-209ENST00000567771 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.37■■■■■ 5.01
SPNS1-209ENST00000567771 OSCARQ8IYS5 282 aa46.36■■■■■ 5.01
SPNS1-209ENST00000567771 TRIM41Q8WV44 630 aa46.18■■■■■ 4.98
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SPNS1-209ENST00000567771 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
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SPNS1-209ENST00000567771 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.01■■■■■ 4.96
SPNS1-209ENST00000567771 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.94■■■■■ 4.95
SPNS1-209ENST00000567771 SOGA1O94964 1423 aa45.9■■■■■ 4.94
SPNS1-209ENST00000567771 CUX1P39880 1505 aa45.85■■■■■ 4.93
SPNS1-209ENST00000567771 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.85■■■■■ 4.93
SPNS1-209ENST00000567771 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
SPNS1-209ENST00000567771 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.69■■■■■ 4.9
SPNS1-209ENST00000567771 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.69■■■■■ 4.9
SPNS1-209ENST00000567771 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.69■■■■■ 4.9
SPNS1-209ENST00000567771 CHD1O14646 1710 aa45.68■■■■■ 4.9
SPNS1-209ENST00000567771 FBLN2P98095 1184 aa45.66■■■■■ 4.9
SPNS1-209ENST00000567771 WDR97A6NE52 1622 aa45.59■■■■■ 4.89
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGEF11O15085 1522 aa45.58■■■■■ 4.89
SPNS1-209ENST00000567771 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.53■■■■■ 4.88
SPNS1-209ENST00000567771 GRIN2BQ13224 1484 aa45.44■■■■■ 4.87
SPNS1-209ENST00000567771 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
SPNS1-209ENST00000567771 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
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SPNS1-209ENST00000567771 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.32■■■■■ 4.85
SPNS1-209ENST00000567771 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.28■■■■■ 4.84
SPNS1-209ENST00000567771 SYNJ2O15056 1496 aa45.24■■■■■ 4.83
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SPNS1-209ENST00000567771 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.22■■■■■ 4.83
SPNS1-209ENST00000567771 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.83
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SPNS1-209ENST00000567771 TOP2BQ02880 1626 aa45.18■■■■■ 4.82
SPNS1-209ENST00000567771 ARAP1Q96P48 1450 aa45.17■■■■■ 4.82
SPNS1-209ENST00000567771 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.16■■■■■ 4.82
SPNS1-209ENST00000567771 ADAMTS12P58397 1594 aa44.86■■■■■ 4.77
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SPNS1-209ENST00000567771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.77■■■■■ 4.76
SPNS1-209ENST00000567771 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.75■■■■■ 4.76
SPNS1-209ENST00000567771 NUP160Q12769 1436 aa44.7■■■■■ 4.75
SPNS1-209ENST00000567771 CEP170Q5SW79 1584 aa44.69■■■■■ 4.74
SPNS1-209ENST00000567771 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
SPNS1-209ENST00000567771 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.55■■■■■ 4.72
SPNS1-209ENST00000567771 SHROOM2Q13796 1616 aa44.43■■■■■ 4.7
SPNS1-209ENST00000567771 KIF27Q86VH2 1401 aa44.33■■■■■ 4.69
SPNS1-209ENST00000567771 IGF1RP08069 1367 aa44.31■■■■■ 4.68
SPNS1-209ENST00000567771 JPH4Q96JJ6 628 aa44.28■■■■■ 4.68
SPNS1-209ENST00000567771 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
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