RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-211	ENST00000567642	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PPP4C-211	ENST00000567642	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PPP4C-211	ENST00000567642	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.95	■■■■□ 3.03
PPP4C-211	ENST00000567642	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PPP4C-211	ENST00000567642	PTPRM	P28827	1452 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PPP4C-211	ENST00000567642	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-211	ENST00000567642	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-211	ENST00000567642	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
PPP4C-211	ENST00000567642	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.79	■■■■□ 3
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.78	■■■■□ 3
PPP4C-211	ENST00000567642	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.77	■■■■□ 3
PPP4C-211	ENST00000567642	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PPP4C-211	ENST00000567642	MLEC	Q14165	292 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-211	ENST00000567642	ATP10A	O60312	1499 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PPP4C-211	ENST00000567642	KDM5C	P41229	1560 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP4C-211	ENST00000567642	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PPP4C-211	ENST00000567642	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PPP4C-211	ENST00000567642	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.7	■■■□□ 2.98
PPP4C-211	ENST00000567642	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-211	ENST00000567642	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-211	ENST00000567642	ABCC1	P33527	1531 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
PPP4C-211	ENST00000567642	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.57	■■■□□ 2.97
PPP4C-211	ENST00000567642	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PPP4C-211	ENST00000567642	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-211	ENST00000567642	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-211	ENST00000567642	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PPP4C-211	ENST00000567642	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
PPP4C-211	ENST00000567642	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PPP4C-211	ENST00000567642	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-211	ENST00000567642	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PPP4C-211	ENST00000567642	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.48	■■■□□ 2.95
PPP4C-211	ENST00000567642	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	AGL	P35573	1532 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PPP4C-211	ENST00000567642	HSPA2	P54652	639 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PPP4C-211	ENST00000567642	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PPP4C-211	ENST00000567642	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
PPP4C-211	ENST00000567642	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PPP4C-211	ENST00000567642	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.93
PPP4C-211	ENST00000567642	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PPP4C-211	ENST00000567642	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PPP4C-211	ENST00000567642	C3	P01024	1663 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PPP4C-211	ENST00000567642	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PPP4C-211	ENST00000567642	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PPP4C-211	ENST00000567642	A2M	P01023	1474 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPP4C-211	ENST00000567642	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PPP4C-211	ENST00000567642	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PPP4C-211	ENST00000567642	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PPP4C-211	ENST00000567642	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PPP4C-211	ENST00000567642	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PPP4C-211	ENST00000567642	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PPP4C-211	ENST00000567642	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PPP4C-211	ENST00000567642	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PPP4C-211	ENST00000567642	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PPP4C-211	ENST00000567642	GGT6	Q6P531	493 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP4C-211	ENST00000567642	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP4C-211	ENST00000567642	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PPP4C-211	ENST00000567642	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PPP4C-211	ENST00000567642	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PPP4C-211	ENST00000567642	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PPP4C-211	ENST00000567642	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PPP4C-211	ENST00000567642	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PPP4C-211	ENST00000567642	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PPP4C-211	ENST00000567642	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
PPP4C-211	ENST00000567642	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	APLP2	Q06481	763 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	NPAT	Q14207	1427 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	KIF3B	O15066	747 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-211	ENST00000567642	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP4C-211	ENST00000567642	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP4C-211	ENST00000567642	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-211	ENST00000567642	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-211	ENST00000567642	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-211	ENST00000567642	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-211	ENST00000567642	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-211	ENST00000567642	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PPP4C-211	ENST00000567642	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.82	■■■□□ 2.84

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