RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.98■■■■□ 3.03
PPP4C-211ENST00000567642 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.97■■■■□ 3.03
PPP4C-211ENST00000567642 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.95■■■■□ 3.03
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.94■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 MADDQ8WXG6 1647 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.89■■■■□ 3.02
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRMP28827 1452 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-211ENST00000567642 PREX2Q70Z35 1606 aa33.83■■■■□ 3.01
PPP4C-211ENST00000567642 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.83■■■■□ 3.01
PPP4C-211ENST00000567642 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
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PPP4C-211ENST00000567642 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.77■■■■□ 3
PPP4C-211ENST00000567642 AFAP1Q8N556 730 aa33.75■■■□□ 2.99
PPP4C-211ENST00000567642 MLECQ14165 292 aa33.74■■■□□ 2.99
PPP4C-211ENST00000567642 ATP10AO60312 1499 aa33.74■■■□□ 2.99
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PPP4C-211ENST00000567642 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.71■■■□□ 2.99
PPP4C-211ENST00000567642 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.7■■■□□ 2.99
PPP4C-211ENST00000567642 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.7■■■□□ 2.98
PPP4C-211ENST00000567642 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.69■■■□□ 2.98
PPP4C-211ENST00000567642 CEP162Q5TB80 1403 aa33.69■■■□□ 2.98
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC1P33527 1531 aa33.69■■■□□ 2.98
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.63■■■□□ 2.97
PPP4C-211ENST00000567642 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.62■■■□□ 2.97
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PPP4C-211ENST00000567642 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.6■■■□□ 2.97
PPP4C-211ENST00000567642 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
PPP4C-211ENST00000567642 ABCA6Q8N139 1617 aa33.59■■■□□ 2.97
PPP4C-211ENST00000567642 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.58■■■□□ 2.97
PPP4C-211ENST00000567642 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.57■■■□□ 2.97
PPP4C-211ENST00000567642 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.55■■■□□ 2.96
PPP4C-211ENST00000567642 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.52■■■□□ 2.96
PPP4C-211ENST00000567642 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.52■■■□□ 2.96
PPP4C-211ENST00000567642 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.52■■■□□ 2.96
PPP4C-211ENST00000567642 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
PPP4C-211ENST00000567642 REREQ9P2R6 1566 aa33.51■■■□□ 2.95
PPP4C-211ENST00000567642 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.5■■■□□ 2.95
PPP4C-211ENST00000567642 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.5■■■□□ 2.95
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.48■■■□□ 2.95
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.44■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 TIAM1Q13009 1591 aa33.43■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 AGLP35573 1532 aa33.39■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.39■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
PPP4C-211ENST00000567642 HSPA2P54652 639 aa33.38■■■□□ 2.93
PPP4C-211ENST00000567642 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
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PPP4C-211ENST00000567642 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.34■■■□□ 2.93
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.93
PPP4C-211ENST00000567642 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
PPP4C-211ENST00000567642 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.31■■■□□ 2.92
PPP4C-211ENST00000567642 C3P01024 1663 aa33.3■■■□□ 2.92
PPP4C-211ENST00000567642 NCOA2Q15596 1464 aa33.29■■■□□ 2.92
PPP4C-211ENST00000567642 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
PPP4C-211ENST00000567642 A2MP01023 1474 aa33.22■■■□□ 2.91
PPP4C-211ENST00000567642 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.22■■■□□ 2.91
PPP4C-211ENST00000567642 MBD5Q9P267 1494 aa33.21■■■□□ 2.91
PPP4C-211ENST00000567642 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.19■■■□□ 2.9
PPP4C-211ENST00000567642 PLXNC1O60486 1568 aa33.18■■■□□ 2.9
PPP4C-211ENST00000567642 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.18■■■□□ 2.9
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.18■■■□□ 2.9
PPP4C-211ENST00000567642 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.17■■■□□ 2.9
PPP4C-211ENST00000567642 MROH2AA6NES4 1674 aa33.15■■■□□ 2.9
PPP4C-211ENST00000567642 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
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PPP4C-211ENST00000567642 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.11■■■□□ 2.89
PPP4C-211ENST00000567642 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.11■■■□□ 2.89
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K1Q13233 1512 aa33.08■■■□□ 2.89
PPP4C-211ENST00000567642 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
PPP4C-211ENST00000567642 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.06■■■□□ 2.88
PPP4C-211ENST00000567642 ZMYM3Q14202 1370 aa33.06■■■□□ 2.88
PPP4C-211ENST00000567642 STRCQ7RTU9 1775 aa33.05■■■□□ 2.88
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.02■■■□□ 2.88
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PPP4C-211ENST00000567642 FBXO41Q8TF61 875 aa33.01■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 TSPY4P0CV99 314 aa32.99■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 TSPY10P0CW01 314 aa32.99■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 APLP2Q06481 763 aa32.99■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 NPATQ14207 1427 aa32.98■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.96■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 KIF3BO15066 747 aa32.95■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.95■■■□□ 2.87
PPP4C-211ENST00000567642 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.94■■■□□ 2.86
PPP4C-211ENST00000567642 MIA2Q96PC5 1412 aa32.89■■■□□ 2.86
PPP4C-211ENST00000567642 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.88■■■□□ 2.85
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRKQ15262 1439 aa32.88■■■□□ 2.85
PPP4C-211ENST00000567642 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.86■■■□□ 2.85
PPP4C-211ENST00000567642 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.85■■■□□ 2.85
PPP4C-211ENST00000567642 CERKQ8TCT0 537 aa32.85■■■□□ 2.85
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
PPP4C-211ENST00000567642 NCOA1Q15788 1441 aa32.82■■■□□ 2.84
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