RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566965.5

RHOT2-215, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 5

Gene RHOT2, Length 879 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-215	ENST00000566965	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RHOT2-215	ENST00000566965	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RHOT2-215	ENST00000566965	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RHOT2-215	ENST00000566965	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RHOT2-215	ENST00000566965	PTPRT	O14522	1441 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RHOT2-215	ENST00000566965	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.51	■■■□□ 2.15
RHOT2-215	ENST00000566965	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		28.49	■■■□□ 2.15
RHOT2-215	ENST00000566965	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.48	■■■□□ 2.15
RHOT2-215	ENST00000566965	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.47	■■■□□ 2.15
RHOT2-215	ENST00000566965	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.46	■■■□□ 2.15
RHOT2-215	ENST00000566965	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.45	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	ATP10A	O60312	1499 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.4	■■■□□ 2.14	6e-6	■■■■■ 27.7
RHOT2-215	ENST00000566965	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		28.4	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.39	■■■□□ 2.14
RHOT2-215	ENST00000566965	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
RHOT2-215	ENST00000566965	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
RHOT2-215	ENST00000566965	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.36	■■■□□ 2.13
RHOT2-215	ENST00000566965	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.35	■■■□□ 2.13
RHOT2-215	ENST00000566965	CLIP1	P30622	1438 aa		28.33	■■■□□ 2.13
RHOT2-215	ENST00000566965	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RHOT2-215	ENST00000566965	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RHOT2-215	ENST00000566965	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
RHOT2-215	ENST00000566965	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.26	■■■□□ 2.12
RHOT2-215	ENST00000566965	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.26	■■■□□ 2.12
RHOT2-215	ENST00000566965	PLCH2	O75038	1416 aa		28.23	■■■□□ 2.11
RHOT2-215	ENST00000566965	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RHOT2-215	ENST00000566965	HSPA1L	P34931	641 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RHOT2-215	ENST00000566965	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RHOT2-215	ENST00000566965	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.2	■■■□□ 2.11
RHOT2-215	ENST00000566965	C3	P01024	1663 aa		28.17	■■■□□ 2.1
RHOT2-215	ENST00000566965	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.16	■■■□□ 2.1
RHOT2-215	ENST00000566965	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RHOT2-215	ENST00000566965	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.14	■■■□□ 2.1
RHOT2-215	ENST00000566965	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
RHOT2-215	ENST00000566965	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RHOT2-215	ENST00000566965	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RHOT2-215	ENST00000566965	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
RHOT2-215	ENST00000566965	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RHOT2-215	ENST00000566965	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RHOT2-215	ENST00000566965	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
RHOT2-215	ENST00000566965	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RHOT2-215	ENST00000566965	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.04	■■■□□ 2.08
RHOT2-215	ENST00000566965	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RHOT2-215	ENST00000566965	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
RHOT2-215	ENST00000566965	KDM5C	P41229	1560 aa		27.99	■■■□□ 2.07
RHOT2-215	ENST00000566965	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.98	■■■□□ 2.07
RHOT2-215	ENST00000566965	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RHOT2-215	ENST00000566965	PKD2	Q13563	968 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RHOT2-215	ENST00000566965	AGL	P35573	1532 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.94	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	TOM1	O60784	492 aa		27.93	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	NPAT	Q14207	1427 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.92	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.9	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RHOT2-215	ENST00000566965	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RHOT2-215	ENST00000566965	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
RHOT2-215	ENST00000566965	PLA2R1	Q13018	1463 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RHOT2-215	ENST00000566965	KIF14	Q15058	1648 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RHOT2-215	ENST00000566965	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RHOT2-215	ENST00000566965	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
RHOT2-215	ENST00000566965	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RHOT2-215	ENST00000566965	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RHOT2-215	ENST00000566965	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RHOT2-215	ENST00000566965	CPS1	P31327	1500 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RHOT2-215	ENST00000566965	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RHOT2-215	ENST00000566965	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
RHOT2-215	ENST00000566965	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RHOT2-215	ENST00000566965	ABCC1	P33527	1531 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RHOT2-215	ENST00000566965	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
RHOT2-215	ENST00000566965	GGT6	Q6P531	493 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RHOT2-215	ENST00000566965	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RHOT2-215	ENST00000566965	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RHOT2-215	ENST00000566965	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RHOT2-215	ENST00000566965	POTEA	Q6S8J7	498 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RHOT2-215	ENST00000566965	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RHOT2-215	ENST00000566965	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.57	■■■□□ 2
RHOT2-215	ENST00000566965	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.57	■■■□□ 2
RHOT2-215	ENST00000566965	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
RHOT2-215	ENST00000566965	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RHOT2-215	ENST00000566965	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.55	■■■□□ 2
RHOT2-215	ENST00000566965	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.55	■■■□□ 2
RHOT2-215	ENST00000566965	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.55	■■■□□ 2

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