RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565589.5

RNPS1-215, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-215	ENST00000565589	MLEC	Q14165	292 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	KIF14	Q15058	1648 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-215	ENST00000565589	HSPA2	P54652	639 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	KDM5C	P41229	1560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	AGL	P35573	1532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-215	ENST00000565589	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	PTPRT	O14522	1441 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	ABCC1	P33527	1531 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	NPAT	Q14207	1427 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RNPS1-215	ENST00000565589	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	PKD2	Q13563	968 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RNPS1-215	ENST00000565589	A2M	P01023	1474 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	GGT6	Q6P531	493 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	C3	P01024	1663 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RNPS1-215	ENST00000565589	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.33	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.32	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	KIF3B	O15066	747 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.3	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RNPS1-215	ENST00000565589	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	TNR	Q92752	1358 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RNPS1-215	ENST00000565589	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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