RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565483.1

STX4-215, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 5

Gene STX4, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-215ENST00000565483 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.54■■■■□ 3.28
STX4-215ENST00000565483 CLIP1P30622 1438 aa35.54■■■■□ 3.28
STX4-215ENST00000565483 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.53■■■■□ 3.28
STX4-215ENST00000565483 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.53■■■■□ 3.28
STX4-215ENST00000565483 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.52■■■■□ 3.28
STX4-215ENST00000565483 MADDQ8WXG6 1647 aa35.52■■■■□ 3.28
STX4-215ENST00000565483 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.48■■■■□ 3.27
STX4-215ENST00000565483 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.45■■■■□ 3.27
STX4-215ENST00000565483 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.44■■■■□ 3.26
STX4-215ENST00000565483 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.43■■■■□ 3.26
STX4-215ENST00000565483 MLECQ14165 292 aa35.41■■■■□ 3.26
STX4-215ENST00000565483 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.39■■■■□ 3.26
STX4-215ENST00000565483 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.39■■■■□ 3.26
STX4-215ENST00000565483 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
STX4-215ENST00000565483 AFAP1Q8N556 730 aa35.36■■■■□ 3.25
STX4-215ENST00000565483 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.32■■■■□ 3.25
STX4-215ENST00000565483 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.32■■■■□ 3.24
STX4-215ENST00000565483 ATP10AO60312 1499 aa35.31■■■■□ 3.24
STX4-215ENST00000565483 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.31■■■■□ 3.24
STX4-215ENST00000565483 PREX2Q70Z35 1606 aa35.29■■■■□ 3.24
STX4-215ENST00000565483 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.28■■■■□ 3.24
STX4-215ENST00000565483 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
STX4-215ENST00000565483 KDM5CP41229 1560 aa35.25■■■■□ 3.23
STX4-215ENST00000565483 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.23■■■■□ 3.23
STX4-215ENST00000565483 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.22■■■■□ 3.23
STX4-215ENST00000565483 ABCC1P33527 1531 aa35.21■■■■□ 3.23
STX4-215ENST00000565483 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.2■■■■□ 3.23
STX4-215ENST00000565483 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.19■■■■□ 3.22
STX4-215ENST00000565483 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
STX4-215ENST00000565483 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.18■■■■□ 3.22
STX4-215ENST00000565483 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.16■■■■□ 3.22
STX4-215ENST00000565483 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.14■■■■□ 3.22
STX4-215ENST00000565483 ABCA6Q8N139 1617 aa35.12■■■■□ 3.21
STX4-215ENST00000565483 CEP162Q5TB80 1403 aa35.12■■■■□ 3.21
STX4-215ENST00000565483 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
STX4-215ENST00000565483 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.11■■■■□ 3.21
STX4-215ENST00000565483 HSPA2P54652 639 aa35.11■■■■□ 3.21
STX4-215ENST00000565483 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.09■■■■□ 3.21
STX4-215ENST00000565483 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.07■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.04■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.04■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 REREQ9P2R6 1566 aa35.01■■■■□ 3.2
STX4-215ENST00000565483 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35■■■■□ 3.19
STX4-215ENST00000565483 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.96■■■■□ 3.19
STX4-215ENST00000565483 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
STX4-215ENST00000565483 AGLP35573 1532 aa34.92■■■■□ 3.18
STX4-215ENST00000565483 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.92■■■■□ 3.18
STX4-215ENST00000565483 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
STX4-215ENST00000565483 TIAM1Q13009 1591 aa34.9■■■■□ 3.18
STX4-215ENST00000565483 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.89■■■■□ 3.18
STX4-215ENST00000565483 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.89■■■■□ 3.18
STX4-215ENST00000565483 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
STX4-215ENST00000565483 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.84■■■■□ 3.17
STX4-215ENST00000565483 ATP7AQ04656 1500 aa34.84■■■■□ 3.17
STX4-215ENST00000565483 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
STX4-215ENST00000565483 C3P01024 1663 aa34.79■■■■□ 3.16
STX4-215ENST00000565483 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
STX4-215ENST00000565483 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.77■■■■□ 3.16
STX4-215ENST00000565483 FBXO41Q8TF61 875 aa34.75■■■■□ 3.15
STX4-215ENST00000565483 NCOA2Q15596 1464 aa34.75■■■■□ 3.15
STX4-215ENST00000565483 A2MP01023 1474 aa34.74■■■■□ 3.15
STX4-215ENST00000565483 MBD5Q9P267 1494 aa34.72■■■■□ 3.15
STX4-215ENST00000565483 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.72■■■■□ 3.15
STX4-215ENST00000565483 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.71■■■■□ 3.15
STX4-215ENST00000565483 PLXNC1O60486 1568 aa34.7■■■■□ 3.14
STX4-215ENST00000565483 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
STX4-215ENST00000565483 GGT6Q6P531 493 aa34.66■■■■□ 3.14
STX4-215ENST00000565483 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.64■■■■□ 3.14
STX4-215ENST00000565483 ZMYM3Q14202 1370 aa34.62■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.6■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.6■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 STRCQ7RTU9 1775 aa34.59■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.58■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 MROH2AA6NES4 1674 aa34.58■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.57■■■■□ 3.13
STX4-215ENST00000565483 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
STX4-215ENST00000565483 CERKQ8TCT0 537 aa34.53■■■■□ 3.12
STX4-215ENST00000565483 NPATQ14207 1427 aa34.53■■■■□ 3.12
STX4-215ENST00000565483 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
STX4-215ENST00000565483 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.51■■■■□ 3.12
STX4-215ENST00000565483 KIF3BO15066 747 aa34.46■■■■□ 3.11
STX4-215ENST00000565483 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.46■■■■□ 3.11
STX4-215ENST00000565483 PTPRKQ15262 1439 aa34.45■■■■□ 3.11
STX4-215ENST00000565483 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.44■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 NCOA1Q15788 1441 aa34.43■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 MAP3K1Q13233 1512 aa34.43■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 TSPY4P0CV99 314 aa34.42■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 TSPY10P0CW01 314 aa34.42■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.42■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.41■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 PTPRTO14522 1441 aa34.39■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.39■■■■□ 3.1
STX4-215ENST00000565483 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.36■■■■□ 3.09
STX4-215ENST00000565483 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.34■■■■□ 3.09
STX4-215ENST00000565483 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
STX4-215ENST00000565483 APLP2Q06481 763 aa34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.4 ms