RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.06	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.05	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.04	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.04	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		41.03	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRM	P28827	1452 aa		41.01	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.01	■■■■■ 4.15
PPP4C-208	ENST00000564966	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.98	■■■■■ 4.15
PPP4C-208	ENST00000564966	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PPP4C-208	ENST00000564966	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PPP4C-208	ENST00000564966	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.94	■■■■■ 4.14
PPP4C-208	ENST00000564966	MLEC	Q14165	292 aa		40.9	■■■■■ 4.14
PPP4C-208	ENST00000564966	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.89	■■■■■ 4.14
PPP4C-208	ENST00000564966	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PPP4C-208	ENST00000564966	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.83	■■■■■ 4.13
PPP4C-208	ENST00000564966	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.82	■■■■■ 4.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP10A	O60312	1499 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PPP4C-208	ENST00000564966	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM5C	P41229	1560 aa		40.71	■■■■■ 4.11
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCC1	P33527	1531 aa		40.68	■■■■■ 4.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP162	Q5TB80	1403 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PPP4C-208	ENST00000564966	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PPP4C-208	ENST00000564966	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.65	■■■■■ 4.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PPP4C-208	ENST00000564966	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.59	■■■■■ 4.09
PPP4C-208	ENST00000564966	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PPP4C-208	ENST00000564966	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PPP4C-208	ENST00000564966	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.09
PPP4C-208	ENST00000564966	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.55	■■■■■ 4.08
PPP4C-208	ENST00000564966	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PPP4C-208	ENST00000564966	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
PPP4C-208	ENST00000564966	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.52	■■■■■ 4.08
PPP4C-208	ENST00000564966	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.5	■■■■■ 4.07
PPP4C-208	ENST00000564966	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.49	■■■■■ 4.07
PPP4C-208	ENST00000564966	HSPA2	P54652	639 aa		40.46	■■■■■ 4.07
PPP4C-208	ENST00000564966	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PPP4C-208	ENST00000564966	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PPP4C-208	ENST00000564966	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.45	■■■■■ 4.07
PPP4C-208	ENST00000564966	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.44	■■■■■ 4.06
PPP4C-208	ENST00000564966	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
PPP4C-208	ENST00000564966	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PPP4C-208	ENST00000564966	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.41	■■■■■ 4.06
PPP4C-208	ENST00000564966	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.34	■■■■■ 4.05
PPP4C-208	ENST00000564966	AGL	P35573	1532 aa		40.34	■■■■■ 4.05
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PPP4C-208	ENST00000564966	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPP4C-208	ENST00000564966	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PPP4C-208	ENST00000564966	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
PPP4C-208	ENST00000564966	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PPP4C-208	ENST00000564966	C3	P01024	1663 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP4C-208	ENST00000564966	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP4C-208	ENST00000564966	A2M	P01023	1474 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PPP4C-208	ENST00000564966	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PPP4C-208	ENST00000564966	GGT6	Q6P531	493 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPP4C-208	ENST00000564966	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.08	■■■■■ 4.01
PPP4C-208	ENST00000564966	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.07	■■■■■ 4
PPP4C-208	ENST00000564966	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.06	■■■■■ 4
PPP4C-208	ENST00000564966	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.06	■■■■■ 4
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.05	■■■■■ 4
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.05	■■■■■ 4
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.01	■■■■■ 4
PPP4C-208	ENST00000564966	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMYM3	Q14202	1370 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PPP4C-208	ENST00000564966	MROH2A	A6NES4	1674 aa		39.99	■■■■□ 3.99
PPP4C-208	ENST00000564966	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	39.99	■■■■□ 3.99
PPP4C-208	ENST00000564966	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		39.96	■■■■□ 3.99
PPP4C-208	ENST00000564966	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	39.94	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		39.94	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	APLP2	Q06481	763 aa		39.92	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPY4	P0CV99	314 aa		39.91	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPY10	P0CW01	314 aa		39.91	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	NPAT	Q14207	1427 aa		39.9	■■■■□ 3.98
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K1	Q13233	1512 aa		39.88	■■■■□ 3.97
PPP4C-208	ENST00000564966	STRC	Q7RTU9	1775 aa		39.87	■■■■□ 3.97
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF3B	O15066	747 aa		39.87	■■■■□ 3.97
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		39.85	■■■■□ 3.97
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		39.84	■■■■□ 3.97
PPP4C-208	ENST00000564966	CERK	Q8TCT0	537 aa		39.82	■■■■□ 3.97
PPP4C-208	ENST00000564966	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		39.78	■■■■□ 3.96
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRK	Q15262	1439 aa		39.76	■■■■□ 3.96
PPP4C-208	ENST00000564966	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		39.73	■■■■□ 3.95
PPP4C-208	ENST00000564966	MIA2	Q96PC5	1412 aa		39.72	■■■■□ 3.95
PPP4C-208	ENST00000564966	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		39.72	■■■■□ 3.95
PPP4C-208	ENST00000564966	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		39.71	■■■■□ 3.95
PPP4C-208	ENST00000564966	NCOA1	Q15788	1441 aa		39.71	■■■■□ 3.95
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRT	O14522	1441 aa		39.7	■■■■□ 3.95

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