RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.72■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 SYNJ2O15056 1496 aa25.71■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.7■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.7■■□□□ 1.71
RRN3-205ENST00000563559 NEFLP07196 543 aa25.69■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 ERCC6Q03468 1493 aa25.69■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.69■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.67■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 CEP170Q5SW79 1584 aa25.66■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.65■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 FKBP8Q14318 412 aa25.65■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.64■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
RRN3-205ENST00000563559 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.62■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.62■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 FOXD1Q16676 465 aa25.61■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.6■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.6■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 NUP160Q12769 1436 aa25.6■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 NCOA1Q15788 1441 aa25.6■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 ADGRL2O95490 1459 aa25.6■■□□□ 1.69
RRN3-205ENST00000563559 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.57■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 JPH4Q96JJ6 628 aa25.55■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 CCDC7Q96M83 1385 aa25.55■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.54■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 PZPP20742 1482 aa25.54■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 KIF14Q15058 1648 aa25.53■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.53■■□□□ 1.68
RRN3-205ENST00000563559 FBLN2P98095 1184 aa25.51■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.51■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.5■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 BCANQ96GW7 911 aa25.5■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.49■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.48■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 ABCA8O94911 1581 aa25.47■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.46■■□□□ 1.67
RRN3-205ENST00000563559 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.43■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 MBD5Q9P267 1494 aa25.42■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.41■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.41■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 ATP10BO94823 1461 aa25.39■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.39■■□□□ 1.66
RRN3-205ENST00000563559 PKD2Q13563 968 aa25.38■■□□□ 1.65
RRN3-205ENST00000563559 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.37■■□□□ 1.65
RRN3-205ENST00000563559 TSPY4P0CV99 314 aa25.34■■□□□ 1.65
RRN3-205ENST00000563559 TSPY10P0CW01 314 aa25.34■■□□□ 1.65
RRN3-205ENST00000563559 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
RRN3-205ENST00000563559 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.32■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 MRS2Q9HD23 443 aa25.31■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.31■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.31■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 NUP155O75694 1391 aa25.3■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 USP47Q96K76 1375 aa25.3■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.3■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.29■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 CCDC184Q52MB2 194 aa25.27■■□□□ 1.64
RRN3-205ENST00000563559 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.26■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 PTPRGP23470 1445 aa25.26■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.24■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 KDM5CP41229 1560 aa25.24■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.24■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 KIF15Q9NS87 1388 aa25.24■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.23■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
RRN3-205ENST00000563559 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.2■■□□□ 1.62
RRN3-205ENST00000563559 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RRN3-205ENST00000563559 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.19■■□□□ 1.62
RRN3-205ENST00000563559 PREX2Q70Z35 1606 aa25.17■■□□□ 1.62
RRN3-205ENST00000563559 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
RRN3-205ENST00000563559 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.14■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.13■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.13■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.1■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.09■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.08■■□□□ 1.61
RRN3-205ENST00000563559 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.07■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 SHROOM2Q13796 1616 aa25.05■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.04■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.04■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 CHD1O14646 1710 aa25.03■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.02■■□□□ 1.6
RRN3-205ENST00000563559 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.02■■□□□ 1.6
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