RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.52■□□□□ 0.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 POTEB2H3BUK9 544 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 POTEJP0CG39 1038 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.41■□□□□ 0.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.39■□□□□ 0.53
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDE4AP27815 886 aa18.37■□□□□ 0.53
USP3-AS1-204ENST00000559861 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.37■□□□□ 0.53
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.34■□□□□ 0.53
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM92Q6UXU6 159 aa18.33■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMC2Q8TDI7 906 aa18.31■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF3CO14782 793 aa18.3■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.3■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 MFSD10Q14728 455 aa18.29■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2orf72A6NCS6 295 aa18.27■□□□□ 0.52
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.26■□□□□ 0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR70Q9NW82 654 aa18.26■□□□□ 0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 LHX8Q68G74 356 aa18.24■□□□□ 0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXK1P85037 733 aa18.21■□□□□ 0.51
USP3-AS1-204ENST00000559861 DSG2Q14126 1118 aa18.2■□□□□ 0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa18.18■□□□□ 0.5
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.14■□□□□ 0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTUD5Q96G74 571 aa18.14■□□□□ 0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLPP6Q8IY26 295 aa18.13■□□□□ 0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 E2F4Q16254 413 aa18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMK2BQ13554 666 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-204ENST00000559861 P3H3Q8IVL6 736 aa18.05■□□□□ 0.48
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.04■□□□□ 0.48
USP3-AS1-204ENST00000559861 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-204ENST00000559861 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC34A2O95436 690 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-204ENST00000559861 OXER1Q8TDS5 423 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-204ENST00000559861 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 DOK7Q18PE1 504 aa17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNPHO15079 494 aa17.87■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 DPYSL4O14531 572 aa17.84■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCRIBQ14160 1630 aa17.83■□□□□ 0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP3K9P80192 1104 aa17.81■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMBP2O15034 1052 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D12O60347 775 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.8■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NBR1Q14596 966 aa17.77■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCANQ96GW7 911 aa17.77■□□□□ 0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDIA6Q15084 440 aa17.76■□□□□ 0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF710Q8N1W2 664 aa17.76■□□□□ 0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR153Q6NV75 609 aa17.73■□□□□ 0.43
USP3-AS1-204ENST00000559861 EVI5O60447 810 aa17.7■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARSIQ5FYB1 569 aa17.7■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.69■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEMA3EO15041 775 aa17.67■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.66■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
USP3-AS1-204ENST00000559861 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUDT7P0C024 238 aa17.62■□□□□ 0.41
USP3-AS1-204ENST00000559861 ST18O60284 1047 aa17.6■□□□□ 0.41
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTGER2P43116 358 aa17.6■□□□□ 0.41
USP3-AS1-204ENST00000559861 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDX12PQ92771 950 aa17.51■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMYD5Q6GMV2 418 aa17.5■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 LHX6Q9UPM6 363 aa17.5■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRXCR2A6NFK2 248 aa17.49■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 JPH4Q96JJ6 628 aa17.47■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF14O94880 888 aa17.46■□□□□ 0.39
USP3-AS1-204ENST00000559861 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOSBP53539 338 aa17.45■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.44■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 OSBPP22059 807 aa17.43■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP17.43■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 MARVELD3Q96A59 401 aa17.43■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPAS1Q99814 870 aa17.42■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 EMP3P54852 163 aa17.41■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF454Q8N9F8 522 aa17.41■□□□□ 0.38
USP3-AS1-204ENST00000559861 TYW1BQ6NUM6 668 aa17.38■□□□□ 0.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERBB3P21860 1342 aa17.38■□□□□ 0.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXW7Q969H0 707 aa17.37■□□□□ 0.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa17.36■□□□□ 0.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.36■□□□□ 0.37
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms