RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.39■■■□□ 2.78
RABGGTA-210ENST00000559586 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.38■■■□□ 2.77
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP162Q5TB80 1403 aa32.33■■■□□ 2.77
RABGGTA-210ENST00000559586 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.32■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.29■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.29■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.28■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF14Q15058 1648 aa32.26■■■□□ 2.76
RABGGTA-210ENST00000559586 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.26■■■□□ 2.75
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP10AO60312 1499 aa32.23■■■□□ 2.75
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXO41Q8TF61 875 aa32.22■■■□□ 2.75
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.21■■■□□ 2.75
RABGGTA-210ENST00000559586 MLECQ14165 292 aa32.2■■■□□ 2.75
RABGGTA-210ENST00000559586 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.19■■■□□ 2.74
RABGGTA-210ENST00000559586 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.18■■■□□ 2.74
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.18■■■□□ 2.74
RABGGTA-210ENST00000559586 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.15■■■□□ 2.74
RABGGTA-210ENST00000559586 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.14■■■□□ 2.74
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.14■■■□□ 2.74
RABGGTA-210ENST00000559586 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.12■■■□□ 2.73
RABGGTA-210ENST00000559586 AFAP1Q8N556 730 aa32.11■■■□□ 2.73
RABGGTA-210ENST00000559586 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.1■■■□□ 2.73
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.1■■■□□ 2.73
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM5CP41229 1560 aa32.09■■■□□ 2.73
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA2P54652 639 aa32.07■■■□□ 2.72
RABGGTA-210ENST00000559586 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.02■■■□□ 2.72
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32■■■□□ 2.71
RABGGTA-210ENST00000559586 PREX2Q70Z35 1606 aa31.99■■■□□ 2.71
RABGGTA-210ENST00000559586 REREQ9P2R6 1566 aa31.98■■■□□ 2.71
RABGGTA-210ENST00000559586 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.96■■■□□ 2.71
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCC1P33527 1531 aa31.95■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.93■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.92■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.91■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 AGLP35573 1532 aa31.9■■■□□ 2.7
RABGGTA-210ENST00000559586 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.87■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCA6Q8N139 1617 aa31.87■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.87■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.85■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.84■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
RABGGTA-210ENST00000559586 CERKQ8TCT0 537 aa31.82■■■□□ 2.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.79■■■□□ 2.68
RABGGTA-210ENST00000559586 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
RABGGTA-210ENST00000559586 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.78■■■□□ 2.68
RABGGTA-210ENST00000559586 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
RABGGTA-210ENST00000559586 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.76■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 TIAM1Q13009 1591 aa31.76■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.75■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.75■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.75■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.74■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.73■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 C3P01024 1663 aa31.72■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.71■■■□□ 2.67
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP3K1Q13233 1512 aa31.68■■■□□ 2.66
RABGGTA-210ENST00000559586 STRCQ7RTU9 1775 aa31.65■■■□□ 2.66
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPRTO14522 1441 aa31.63■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP7AQ04656 1500 aa31.63■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 NPATQ14207 1427 aa31.62■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.62■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 MROH2AA6NES4 1674 aa31.6■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 A2MP01023 1474 aa31.59■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 ZMYM3Q14202 1370 aa31.58■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
RABGGTA-210ENST00000559586 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
RABGGTA-210ENST00000559586 NCOA2Q15596 1464 aa31.57■■■□□ 2.64
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RABGGTA-210ENST00000559586 PLXNC1O60486 1568 aa31.54■■■□□ 2.64
RABGGTA-210ENST00000559586 NCOA1Q15788 1441 aa31.51■■■□□ 2.64
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RABGGTA-210ENST00000559586 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.48■■■□□ 2.63
RABGGTA-210ENST00000559586 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.47■■■□□ 2.63
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
RABGGTA-210ENST00000559586 MBD5Q9P267 1494 aa31.46■■■□□ 2.63
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RABGGTA-210ENST00000559586 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
RABGGTA-210ENST00000559586 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.42■■■□□ 2.62
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
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RABGGTA-210ENST00000559586 APLP2Q06481 763 aa31.39■■■□□ 2.62
RABGGTA-210ENST00000559586 PKD2Q13563 968 aa31.38■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.38■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2R1Q13018 1463 aa31.35■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.35■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.34■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.33■■■□□ 2.61
RABGGTA-210ENST00000559586 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.32■■■□□ 2.6
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
RABGGTA-210ENST00000559586 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.3■■■□□ 2.6
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